Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PLD3Q8IV08 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLD3Q8IV08 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLD3Q8IV08 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLD3Q8IV08 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLD3Q8IV08 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLD3Q8IV08 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLD3Q8IV08 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLD3Q8IV08 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLD3Q8IV08 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLD3Q8IV08 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLD3Q8IV08 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLD3Q8IV08 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLD3Q8IV08 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLD3Q8IV08 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PLD3Q8IV08 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLD3Q8IV08 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLD3Q8IV08 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PLD3Q8IV08 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLD3Q8IV08 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLD3Q8IV08 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLD3Q8IV08 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLD3Q8IV08 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLD3Q8IV08 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLD3Q8IV08 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLD3Q8IV08 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLD3Q8IV08 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLD3Q8IV08 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLD3Q8IV08 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLD3Q8IV08 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLD3Q8IV08 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLD3Q8IV08 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PLD3Q8IV08 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLD3Q8IV08 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLD3Q8IV08 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLD3Q8IV08 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLD3Q8IV08 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLD3Q8IV08 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PLD3Q8IV08 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLD3Q8IV08 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLD3Q8IV08 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLD3Q8IV08 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLD3Q8IV08 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLD3Q8IV08 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLD3Q8IV08 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLD3Q8IV08 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLD3Q8IV08 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLD3Q8IV08 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLD3Q8IV08 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLD3Q8IV08 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLD3Q8IV08 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLD3Q8IV08 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLD3Q8IV08 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLD3Q8IV08 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLD3Q8IV08 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLD3Q8IV08 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLD3Q8IV08 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLD3Q8IV08 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLD3Q8IV08 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLD3Q8IV08 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLD3Q8IV08 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLD3Q8IV08 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLD3Q8IV08 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLD3Q8IV08 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLD3Q8IV08 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLD3Q8IV08 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PLD3Q8IV08 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLD3Q8IV08 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLD3Q8IV08 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLD3Q8IV08 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLD3Q8IV08 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLD3Q8IV08 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLD3Q8IV08 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PLD3Q8IV08 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLD3Q8IV08 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLD3Q8IV08 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLD3Q8IV08 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLD3Q8IV08 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLD3Q8IV08 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLD3Q8IV08 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLD3Q8IV08 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLD3Q8IV08 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLD3Q8IV08 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLD3Q8IV08 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLD3Q8IV08 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms