Protein–RNA interactions for Protein: Q86V88

MDP1, Magnesium-dependent phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDP1Q86V88 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDP1Q86V88 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDP1Q86V88 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDP1Q86V88 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDP1Q86V88 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDP1Q86V88 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDP1Q86V88 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MDP1Q86V88 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDP1Q86V88 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDP1Q86V88 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDP1Q86V88 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDP1Q86V88 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDP1Q86V88 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDP1Q86V88 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDP1Q86V88 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDP1Q86V88 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDP1Q86V88 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDP1Q86V88 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDP1Q86V88 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDP1Q86V88 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDP1Q86V88 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDP1Q86V88 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MDP1Q86V88 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDP1Q86V88 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDP1Q86V88 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDP1Q86V88 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDP1Q86V88 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDP1Q86V88 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDP1Q86V88 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDP1Q86V88 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDP1Q86V88 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDP1Q86V88 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDP1Q86V88 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDP1Q86V88 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDP1Q86V88 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDP1Q86V88 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDP1Q86V88 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDP1Q86V88 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDP1Q86V88 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDP1Q86V88 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDP1Q86V88 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDP1Q86V88 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MDP1Q86V88 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDP1Q86V88 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDP1Q86V88 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDP1Q86V88 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDP1Q86V88 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDP1Q86V88 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDP1Q86V88 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDP1Q86V88 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDP1Q86V88 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDP1Q86V88 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDP1Q86V88 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDP1Q86V88 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDP1Q86V88 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDP1Q86V88 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDP1Q86V88 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDP1Q86V88 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDP1Q86V88 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDP1Q86V88 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDP1Q86V88 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDP1Q86V88 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDP1Q86V88 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDP1Q86V88 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDP1Q86V88 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDP1Q86V88 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDP1Q86V88 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDP1Q86V88 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDP1Q86V88 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDP1Q86V88 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDP1Q86V88 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDP1Q86V88 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDP1Q86V88 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDP1Q86V88 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDP1Q86V88 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDP1Q86V88 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDP1Q86V88 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDP1Q86V88 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDP1Q86V88 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDP1Q86V88 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDP1Q86V88 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDP1Q86V88 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDP1Q86V88 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDP1Q86V88 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDP1Q86V88 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDP1Q86V88 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDP1Q86V88 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDP1Q86V88 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDP1Q86V88 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDP1Q86V88 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDP1Q86V88 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDP1Q86V88 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDP1Q86V88 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDP1Q86V88 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDP1Q86V88 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDP1Q86V88 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDP1Q86V88 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDP1Q86V88 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDP1Q86V88 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDP1Q86V88 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms