Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
PBRM1Q86U86 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC49.6■■■■■ 5.53
PBRM1Q86U86 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.58■■■■■ 5.53
PBRM1Q86U86 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC49.53■■■■■ 5.52
PBRM1Q86U86 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
PBRM1Q86U86 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC49.42■■■■■ 5.5
PBRM1Q86U86 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC49.41■■■■■ 5.5
PBRM1Q86U86 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC49.37■■■■■ 5.49
PBRM1Q86U86 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC49.33■■■■■ 5.49
PBRM1Q86U86 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.31■■■■■ 5.48
PBRM1Q86U86 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
PBRM1Q86U86 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC49.19■■■■■ 5.46
PBRM1Q86U86 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.18■■■■■ 5.46
PBRM1Q86U86 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.18■■■■■ 5.46
PBRM1Q86U86 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.14■■■■■ 5.46
PBRM1Q86U86 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC49.14■■■■■ 5.46
PBRM1Q86U86 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.05■■■■■ 5.44
PBRM1Q86U86 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
PBRM1Q86U86 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.98■■■■■ 5.43
PBRM1Q86U86 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC48.92■■■■■ 5.42
PBRM1Q86U86 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC48.91■■■■■ 5.42
PBRM1Q86U86 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
PBRM1Q86U86 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC48.88■■■■■ 5.42
PBRM1Q86U86 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
PBRM1Q86U86 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC48.85■■■■■ 5.41
PBRM1Q86U86 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC48.82■■■■■ 5.41
PBRM1Q86U86 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
PBRM1Q86U86 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC48.78■■■■■ 5.4
PBRM1Q86U86 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
PBRM1Q86U86 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.38
PBRM1Q86U86 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC48.68■■■■■ 5.38
PBRM1Q86U86 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC48.64■■■■■ 5.38
PBRM1Q86U86 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC48.64■■■■■ 5.38
PBRM1Q86U86 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
PBRM1Q86U86 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.37
PBRM1Q86U86 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC48.6■■■■■ 5.37
PBRM1Q86U86 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC48.58■■■■■ 5.37
PBRM1Q86U86 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
PBRM1Q86U86 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC48.58■■■■■ 5.37
PBRM1Q86U86 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.57■■■■■ 5.37
PBRM1Q86U86 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC48.55■■■■■ 5.36
PBRM1Q86U86 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
PBRM1Q86U86 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC48.52■■■■■ 5.36
PBRM1Q86U86 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
PBRM1Q86U86 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
PBRM1Q86U86 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC48.43■■■■■ 5.34
PBRM1Q86U86 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC48.4■■■■■ 5.34
PBRM1Q86U86 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
PBRM1Q86U86 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.37■■■■■ 5.33
PBRM1Q86U86 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC48.37■■■■■ 5.33
PBRM1Q86U86 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC48.35■■■■■ 5.33
PBRM1Q86U86 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC48.35■■■■■ 5.33
PBRM1Q86U86 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.26■■■■■ 5.32
PBRM1Q86U86 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC48.24■■■■■ 5.31
PBRM1Q86U86 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.24■■■■■ 5.31
PBRM1Q86U86 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
PBRM1Q86U86 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
PBRM1Q86U86 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC48.2■■■■■ 5.31
PBRM1Q86U86 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
PBRM1Q86U86 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
PBRM1Q86U86 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
PBRM1Q86U86 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
PBRM1Q86U86 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
PBRM1Q86U86 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
PBRM1Q86U86 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC47.87■■■■■ 5.25
PBRM1Q86U86 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC47.87■■■■■ 5.25
PBRM1Q86U86 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.86■■■■■ 5.25
PBRM1Q86U86 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC47.78■■■■■ 5.24
PBRM1Q86U86 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC47.78■■■■■ 5.24
PBRM1Q86U86 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
PBRM1Q86U86 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
PBRM1Q86U86 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC47.73■■■■■ 5.23
PBRM1Q86U86 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
PBRM1Q86U86 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
PBRM1Q86U86 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.68■■■■■ 5.22
PBRM1Q86U86 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC47.68■■■■■ 5.22
PBRM1Q86U86 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
PBRM1Q86U86 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.66■■■■■ 5.22
PBRM1Q86U86 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC47.66■■■■■ 5.22
PBRM1Q86U86 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.64■■■■■ 5.22
PBRM1Q86U86 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.63■■■■■ 5.21
PBRM1Q86U86 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC47.62■■■■■ 5.21
PBRM1Q86U86 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
PBRM1Q86U86 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
PBRM1Q86U86 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
PBRM1Q86U86 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC47.57■■■■■ 5.2
PBRM1Q86U86 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
PBRM1Q86U86 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.54■■■■■ 5.2
PBRM1Q86U86 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC47.54■■■■■ 5.2
PBRM1Q86U86 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
PBRM1Q86U86 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
PBRM1Q86U86 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC47.49■■■■■ 5.19
PBRM1Q86U86 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC47.49■■■■■ 5.19
PBRM1Q86U86 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC47.48■■■■■ 5.19
PBRM1Q86U86 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC47.48■■■■■ 5.19
PBRM1Q86U86 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
PBRM1Q86U86 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC47.43■■■■■ 5.18
PBRM1Q86U86 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
PBRM1Q86U86 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
PBRM1Q86U86 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms