Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z769

SLC35E3, Solute carrier family 35 member E3, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E3Q7Z769 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35E3Q7Z769 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35E3Q7Z769 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35E3Q7Z769 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35E3Q7Z769 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC35E3Q7Z769 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC35E3Q7Z769 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC35E3Q7Z769 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC35E3Q7Z769 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC35E3Q7Z769 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC35E3Q7Z769 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC35E3Q7Z769 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC35E3Q7Z769 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35E3Q7Z769 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35E3Q7Z769 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35E3Q7Z769 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35E3Q7Z769 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35E3Q7Z769 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35E3Q7Z769 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35E3Q7Z769 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35E3Q7Z769 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35E3Q7Z769 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35E3Q7Z769 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35E3Q7Z769 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC35E3Q7Z769 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC35E3Q7Z769 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35E3Q7Z769 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35E3Q7Z769 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35E3Q7Z769 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35E3Q7Z769 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35E3Q7Z769 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35E3Q7Z769 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35E3Q7Z769 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35E3Q7Z769 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35E3Q7Z769 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35E3Q7Z769 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35E3Q7Z769 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35E3Q7Z769 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35E3Q7Z769 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35E3Q7Z769 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35E3Q7Z769 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35E3Q7Z769 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35E3Q7Z769 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35E3Q7Z769 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35E3Q7Z769 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35E3Q7Z769 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35E3Q7Z769 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35E3Q7Z769 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35E3Q7Z769 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35E3Q7Z769 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35E3Q7Z769 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35E3Q7Z769 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35E3Q7Z769 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35E3Q7Z769 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35E3Q7Z769 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35E3Q7Z769 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35E3Q7Z769 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35E3Q7Z769 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35E3Q7Z769 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35E3Q7Z769 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35E3Q7Z769 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35E3Q7Z769 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35E3Q7Z769 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35E3Q7Z769 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35E3Q7Z769 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35E3Q7Z769 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35E3Q7Z769 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35E3Q7Z769 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35E3Q7Z769 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35E3Q7Z769 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35E3Q7Z769 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35E3Q7Z769 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35E3Q7Z769 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35E3Q7Z769 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35E3Q7Z769 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35E3Q7Z769 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35E3Q7Z769 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35E3Q7Z769 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35E3Q7Z769 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35E3Q7Z769 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35E3Q7Z769 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35E3Q7Z769 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35E3Q7Z769 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC35E3Q7Z769 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35E3Q7Z769 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35E3Q7Z769 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35E3Q7Z769 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35E3Q7Z769 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35E3Q7Z769 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35E3Q7Z769 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35E3Q7Z769 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35E3Q7Z769 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35E3Q7Z769 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35E3Q7Z769 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35E3Q7Z769 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35E3Q7Z769 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35E3Q7Z769 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35E3Q7Z769 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC35E3Q7Z769 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC35E3Q7Z769 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms