Protein–RNA interactions for Protein: Q7L273

KCTD9, BTB/POZ domain-containing protein KCTD9, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD9Q7L273 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD9Q7L273 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD9Q7L273 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD9Q7L273 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD9Q7L273 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD9Q7L273 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD9Q7L273 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD9Q7L273 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD9Q7L273 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD9Q7L273 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD9Q7L273 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD9Q7L273 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD9Q7L273 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD9Q7L273 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD9Q7L273 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD9Q7L273 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD9Q7L273 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD9Q7L273 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD9Q7L273 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD9Q7L273 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD9Q7L273 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCTD9Q7L273 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCTD9Q7L273 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCTD9Q7L273 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD9Q7L273 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD9Q7L273 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD9Q7L273 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD9Q7L273 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCTD9Q7L273 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCTD9Q7L273 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD9Q7L273 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD9Q7L273 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD9Q7L273 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCTD9Q7L273 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCTD9Q7L273 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCTD9Q7L273 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCTD9Q7L273 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCTD9Q7L273 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCTD9Q7L273 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCTD9Q7L273 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCTD9Q7L273 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCTD9Q7L273 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCTD9Q7L273 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
KCTD9Q7L273 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCTD9Q7L273 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCTD9Q7L273 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCTD9Q7L273 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCTD9Q7L273 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCTD9Q7L273 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCTD9Q7L273 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCTD9Q7L273 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCTD9Q7L273 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD9Q7L273 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD9Q7L273 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCTD9Q7L273 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD9Q7L273 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD9Q7L273 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD9Q7L273 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD9Q7L273 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD9Q7L273 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD9Q7L273 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD9Q7L273 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD9Q7L273 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD9Q7L273 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD9Q7L273 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD9Q7L273 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD9Q7L273 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD9Q7L273 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD9Q7L273 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD9Q7L273 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD9Q7L273 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD9Q7L273 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD9Q7L273 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD9Q7L273 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCTD9Q7L273 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCTD9Q7L273 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCTD9Q7L273 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCTD9Q7L273 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCTD9Q7L273 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD9Q7L273 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD9Q7L273 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD9Q7L273 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCTD9Q7L273 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD9Q7L273 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD9Q7L273 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD9Q7L273 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD9Q7L273 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD9Q7L273 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD9Q7L273 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD9Q7L273 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD9Q7L273 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD9Q7L273 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD9Q7L273 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD9Q7L273 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD9Q7L273 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD9Q7L273 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD9Q7L273 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD9Q7L273 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD9Q7L273 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD9Q7L273 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms