Protein–RNA interactions for Protein: Q7L273

KCTD9, BTB/POZ domain-containing protein KCTD9, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD9Q7L273 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCTD9Q7L273 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCTD9Q7L273 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCTD9Q7L273 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCTD9Q7L273 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCTD9Q7L273 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCTD9Q7L273 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCTD9Q7L273 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD9Q7L273 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCTD9Q7L273 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KCTD9Q7L273 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCTD9Q7L273 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD9Q7L273 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCTD9Q7L273 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCTD9Q7L273 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCTD9Q7L273 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCTD9Q7L273 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCTD9Q7L273 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCTD9Q7L273 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCTD9Q7L273 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCTD9Q7L273 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCTD9Q7L273 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCTD9Q7L273 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCTD9Q7L273 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCTD9Q7L273 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCTD9Q7L273 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCTD9Q7L273 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCTD9Q7L273 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCTD9Q7L273 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD9Q7L273 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCTD9Q7L273 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD9Q7L273 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD9Q7L273 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD9Q7L273 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCTD9Q7L273 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCTD9Q7L273 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCTD9Q7L273 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCTD9Q7L273 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCTD9Q7L273 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCTD9Q7L273 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD9Q7L273 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD9Q7L273 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD9Q7L273 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD9Q7L273 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD9Q7L273 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCTD9Q7L273 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCTD9Q7L273 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCTD9Q7L273 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCTD9Q7L273 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCTD9Q7L273 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD9Q7L273 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD9Q7L273 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD9Q7L273 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCTD9Q7L273 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCTD9Q7L273 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCTD9Q7L273 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCTD9Q7L273 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCTD9Q7L273 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCTD9Q7L273 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCTD9Q7L273 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCTD9Q7L273 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCTD9Q7L273 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCTD9Q7L273 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCTD9Q7L273 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCTD9Q7L273 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCTD9Q7L273 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCTD9Q7L273 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD9Q7L273 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD9Q7L273 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD9Q7L273 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCTD9Q7L273 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD9Q7L273 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD9Q7L273 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCTD9Q7L273 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD9Q7L273 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD9Q7L273 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD9Q7L273 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD9Q7L273 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD9Q7L273 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD9Q7L273 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD9Q7L273 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD9Q7L273 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD9Q7L273 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD9Q7L273 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD9Q7L273 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD9Q7L273 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD9Q7L273 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD9Q7L273 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCTD9Q7L273 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD9Q7L273 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD9Q7L273 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD9Q7L273 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD9Q7L273 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD9Q7L273 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD9Q7L273 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD9Q7L273 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCTD9Q7L273 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD9Q7L273 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD9Q7L273 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD9Q7L273 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms