Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP29

PQLC2, Lysosomal amino acid transporter 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2Q6ZP29 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PQLC2Q6ZP29 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PQLC2Q6ZP29 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PQLC2Q6ZP29 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PQLC2Q6ZP29 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PQLC2Q6ZP29 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PQLC2Q6ZP29 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PQLC2Q6ZP29 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PQLC2Q6ZP29 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PQLC2Q6ZP29 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PQLC2Q6ZP29 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PQLC2Q6ZP29 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PQLC2Q6ZP29 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PQLC2Q6ZP29 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PQLC2Q6ZP29 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PQLC2Q6ZP29 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PQLC2Q6ZP29 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PQLC2Q6ZP29 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PQLC2Q6ZP29 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PQLC2Q6ZP29 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PQLC2Q6ZP29 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PQLC2Q6ZP29 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PQLC2Q6ZP29 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PQLC2Q6ZP29 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PQLC2Q6ZP29 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PQLC2Q6ZP29 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PQLC2Q6ZP29 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PQLC2Q6ZP29 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PQLC2Q6ZP29 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PQLC2Q6ZP29 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PQLC2Q6ZP29 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PQLC2Q6ZP29 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PQLC2Q6ZP29 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PQLC2Q6ZP29 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC2Q6ZP29 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC2Q6ZP29 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PQLC2Q6ZP29 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PQLC2Q6ZP29 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PQLC2Q6ZP29 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PQLC2Q6ZP29 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PQLC2Q6ZP29 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC2Q6ZP29 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC2Q6ZP29 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC2Q6ZP29 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PQLC2Q6ZP29 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PQLC2Q6ZP29 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PQLC2Q6ZP29 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PQLC2Q6ZP29 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PQLC2Q6ZP29 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PQLC2Q6ZP29 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PQLC2Q6ZP29 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PQLC2Q6ZP29 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PQLC2Q6ZP29 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PQLC2Q6ZP29 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PQLC2Q6ZP29 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PQLC2Q6ZP29 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PQLC2Q6ZP29 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PQLC2Q6ZP29 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PQLC2Q6ZP29 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PQLC2Q6ZP29 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PQLC2Q6ZP29 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PQLC2Q6ZP29 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PQLC2Q6ZP29 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PQLC2Q6ZP29 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PQLC2Q6ZP29 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PQLC2Q6ZP29 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PQLC2Q6ZP29 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PQLC2Q6ZP29 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PQLC2Q6ZP29 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PQLC2Q6ZP29 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PQLC2Q6ZP29 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PQLC2Q6ZP29 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PQLC2Q6ZP29 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PQLC2Q6ZP29 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PQLC2Q6ZP29 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PQLC2Q6ZP29 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PQLC2Q6ZP29 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PQLC2Q6ZP29 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PQLC2Q6ZP29 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PQLC2Q6ZP29 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PQLC2Q6ZP29 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PQLC2Q6ZP29 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PQLC2Q6ZP29 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PQLC2Q6ZP29 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PQLC2Q6ZP29 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PQLC2Q6ZP29 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PQLC2Q6ZP29 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PQLC2Q6ZP29 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PQLC2Q6ZP29 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PQLC2Q6ZP29 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PQLC2Q6ZP29 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PQLC2Q6ZP29 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PQLC2Q6ZP29 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PQLC2Q6ZP29 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PQLC2Q6ZP29 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PQLC2Q6ZP29 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PQLC2Q6ZP29 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PQLC2Q6ZP29 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PQLC2Q6ZP29 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PQLC2Q6ZP29 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms