Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE24

RBMS3, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS3Q6XE24 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBMS3Q6XE24 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBMS3Q6XE24 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBMS3Q6XE24 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBMS3Q6XE24 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBMS3Q6XE24 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBMS3Q6XE24 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBMS3Q6XE24 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBMS3Q6XE24 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBMS3Q6XE24 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBMS3Q6XE24 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBMS3Q6XE24 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBMS3Q6XE24 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBMS3Q6XE24 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBMS3Q6XE24 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBMS3Q6XE24 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBMS3Q6XE24 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBMS3Q6XE24 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBMS3Q6XE24 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBMS3Q6XE24 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBMS3Q6XE24 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBMS3Q6XE24 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBMS3Q6XE24 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBMS3Q6XE24 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBMS3Q6XE24 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBMS3Q6XE24 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBMS3Q6XE24 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBMS3Q6XE24 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBMS3Q6XE24 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBMS3Q6XE24 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBMS3Q6XE24 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBMS3Q6XE24 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBMS3Q6XE24 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBMS3Q6XE24 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBMS3Q6XE24 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBMS3Q6XE24 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBMS3Q6XE24 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBMS3Q6XE24 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RBMS3Q6XE24 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBMS3Q6XE24 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBMS3Q6XE24 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBMS3Q6XE24 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBMS3Q6XE24 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBMS3Q6XE24 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBMS3Q6XE24 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBMS3Q6XE24 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBMS3Q6XE24 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBMS3Q6XE24 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBMS3Q6XE24 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBMS3Q6XE24 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBMS3Q6XE24 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBMS3Q6XE24 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBMS3Q6XE24 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBMS3Q6XE24 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RBMS3Q6XE24 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBMS3Q6XE24 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBMS3Q6XE24 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBMS3Q6XE24 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBMS3Q6XE24 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBMS3Q6XE24 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBMS3Q6XE24 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBMS3Q6XE24 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBMS3Q6XE24 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBMS3Q6XE24 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBMS3Q6XE24 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBMS3Q6XE24 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBMS3Q6XE24 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBMS3Q6XE24 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBMS3Q6XE24 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBMS3Q6XE24 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RBMS3Q6XE24 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RBMS3Q6XE24 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBMS3Q6XE24 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBMS3Q6XE24 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBMS3Q6XE24 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBMS3Q6XE24 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBMS3Q6XE24 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBMS3Q6XE24 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBMS3Q6XE24 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBMS3Q6XE24 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBMS3Q6XE24 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBMS3Q6XE24 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBMS3Q6XE24 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBMS3Q6XE24 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBMS3Q6XE24 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBMS3Q6XE24 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBMS3Q6XE24 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBMS3Q6XE24 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBMS3Q6XE24 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBMS3Q6XE24 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBMS3Q6XE24 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBMS3Q6XE24 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBMS3Q6XE24 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBMS3Q6XE24 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBMS3Q6XE24 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RBMS3Q6XE24 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBMS3Q6XE24 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBMS3Q6XE24 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBMS3Q6XE24 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBMS3Q6XE24 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms