Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TREML4Q6UXN2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREML4Q6UXN2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREML4Q6UXN2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML4Q6UXN2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML4Q6UXN2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREML4Q6UXN2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TREML4Q6UXN2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREML4Q6UXN2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREML4Q6UXN2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREML4Q6UXN2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREML4Q6UXN2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TREML4Q6UXN2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TREML4Q6UXN2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TREML4Q6UXN2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREML4Q6UXN2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREML4Q6UXN2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREML4Q6UXN2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREML4Q6UXN2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREML4Q6UXN2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREML4Q6UXN2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREML4Q6UXN2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREML4Q6UXN2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREML4Q6UXN2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREML4Q6UXN2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREML4Q6UXN2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TREML4Q6UXN2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREML4Q6UXN2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREML4Q6UXN2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREML4Q6UXN2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREML4Q6UXN2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREML4Q6UXN2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TREML4Q6UXN2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TREML4Q6UXN2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TREML4Q6UXN2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREML4Q6UXN2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREML4Q6UXN2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREML4Q6UXN2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREML4Q6UXN2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREML4Q6UXN2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREML4Q6UXN2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREML4Q6UXN2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREML4Q6UXN2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREML4Q6UXN2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TREML4Q6UXN2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREML4Q6UXN2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TREML4Q6UXN2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREML4Q6UXN2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREML4Q6UXN2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREML4Q6UXN2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREML4Q6UXN2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREML4Q6UXN2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREML4Q6UXN2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREML4Q6UXN2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREML4Q6UXN2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREML4Q6UXN2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREML4Q6UXN2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREML4Q6UXN2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREML4Q6UXN2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML4Q6UXN2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML4Q6UXN2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML4Q6UXN2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREML4Q6UXN2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TREML4Q6UXN2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms