Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C19orf48Q6RUI8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C19orf48Q6RUI8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
C19orf48Q6RUI8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C19orf48Q6RUI8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C19orf48Q6RUI8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C19orf48Q6RUI8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C19orf48Q6RUI8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C19orf48Q6RUI8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C19orf48Q6RUI8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
C19orf48Q6RUI8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C19orf48Q6RUI8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C19orf48Q6RUI8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C19orf48Q6RUI8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C19orf48Q6RUI8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
C19orf48Q6RUI8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C19orf48Q6RUI8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C19orf48Q6RUI8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C19orf48Q6RUI8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C19orf48Q6RUI8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C19orf48Q6RUI8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C19orf48Q6RUI8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C19orf48Q6RUI8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C19orf48Q6RUI8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
C19orf48Q6RUI8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C19orf48Q6RUI8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
C19orf48Q6RUI8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C19orf48Q6RUI8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C19orf48Q6RUI8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C19orf48Q6RUI8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C19orf48Q6RUI8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C19orf48Q6RUI8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
C19orf48Q6RUI8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C19orf48Q6RUI8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C19orf48Q6RUI8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C19orf48Q6RUI8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C19orf48Q6RUI8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C19orf48Q6RUI8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C19orf48Q6RUI8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C19orf48Q6RUI8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C19orf48Q6RUI8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C19orf48Q6RUI8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C19orf48Q6RUI8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C19orf48Q6RUI8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C19orf48Q6RUI8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C19orf48Q6RUI8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C19orf48Q6RUI8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C19orf48Q6RUI8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C19orf48Q6RUI8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C19orf48Q6RUI8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C19orf48Q6RUI8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C19orf48Q6RUI8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C19orf48Q6RUI8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C19orf48Q6RUI8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C19orf48Q6RUI8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C19orf48Q6RUI8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C19orf48Q6RUI8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C19orf48Q6RUI8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C19orf48Q6RUI8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C19orf48Q6RUI8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C19orf48Q6RUI8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C19orf48Q6RUI8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C19orf48Q6RUI8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C19orf48Q6RUI8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C19orf48Q6RUI8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
C19orf48Q6RUI8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
C19orf48Q6RUI8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C19orf48Q6RUI8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C19orf48Q6RUI8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C19orf48Q6RUI8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C19orf48Q6RUI8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C19orf48Q6RUI8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C19orf48Q6RUI8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C19orf48Q6RUI8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C19orf48Q6RUI8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C19orf48Q6RUI8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C19orf48Q6RUI8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
C19orf48Q6RUI8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C19orf48Q6RUI8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C19orf48Q6RUI8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C19orf48Q6RUI8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C19orf48Q6RUI8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C19orf48Q6RUI8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C19orf48Q6RUI8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C19orf48Q6RUI8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
C19orf48Q6RUI8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C19orf48Q6RUI8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C19orf48Q6RUI8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
C19orf48Q6RUI8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C19orf48Q6RUI8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C19orf48Q6RUI8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
C19orf48Q6RUI8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C19orf48Q6RUI8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C19orf48Q6RUI8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C19orf48Q6RUI8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C19orf48Q6RUI8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C19orf48Q6RUI8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C19orf48Q6RUI8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C19orf48Q6RUI8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C19orf48Q6RUI8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms