Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H8

TMEM53, Transmembrane protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM53Q6P2H8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM53Q6P2H8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM53Q6P2H8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM53Q6P2H8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM53Q6P2H8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM53Q6P2H8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM53Q6P2H8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM53Q6P2H8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM53Q6P2H8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM53Q6P2H8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM53Q6P2H8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM53Q6P2H8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM53Q6P2H8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM53Q6P2H8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM53Q6P2H8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM53Q6P2H8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM53Q6P2H8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM53Q6P2H8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM53Q6P2H8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM53Q6P2H8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM53Q6P2H8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM53Q6P2H8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM53Q6P2H8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM53Q6P2H8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM53Q6P2H8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM53Q6P2H8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM53Q6P2H8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM53Q6P2H8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM53Q6P2H8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM53Q6P2H8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM53Q6P2H8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM53Q6P2H8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM53Q6P2H8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM53Q6P2H8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM53Q6P2H8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM53Q6P2H8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM53Q6P2H8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM53Q6P2H8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM53Q6P2H8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM53Q6P2H8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM53Q6P2H8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM53Q6P2H8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM53Q6P2H8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM53Q6P2H8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM53Q6P2H8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM53Q6P2H8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM53Q6P2H8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM53Q6P2H8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM53Q6P2H8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM53Q6P2H8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM53Q6P2H8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM53Q6P2H8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM53Q6P2H8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM53Q6P2H8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM53Q6P2H8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM53Q6P2H8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM53Q6P2H8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM53Q6P2H8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM53Q6P2H8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM53Q6P2H8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM53Q6P2H8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM53Q6P2H8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM53Q6P2H8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM53Q6P2H8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM53Q6P2H8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM53Q6P2H8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM53Q6P2H8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM53Q6P2H8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM53Q6P2H8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM53Q6P2H8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM53Q6P2H8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM53Q6P2H8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM53Q6P2H8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM53Q6P2H8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM53Q6P2H8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM53Q6P2H8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM53Q6P2H8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM53Q6P2H8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM53Q6P2H8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM53Q6P2H8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM53Q6P2H8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM53Q6P2H8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM53Q6P2H8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM53Q6P2H8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM53Q6P2H8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM53Q6P2H8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM53Q6P2H8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM53Q6P2H8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM53Q6P2H8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM53Q6P2H8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM53Q6P2H8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM53Q6P2H8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM53Q6P2H8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM53Q6P2H8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM53Q6P2H8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM53Q6P2H8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM53Q6P2H8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM53Q6P2H8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM53Q6P2H8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM53Q6P2H8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms