Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL54Q6P161 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL54Q6P161 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL54Q6P161 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL54Q6P161 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL54Q6P161 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL54Q6P161 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRPL54Q6P161 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL54Q6P161 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL54Q6P161 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL54Q6P161 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL54Q6P161 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL54Q6P161 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL54Q6P161 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL54Q6P161 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL54Q6P161 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL54Q6P161 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL54Q6P161 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL54Q6P161 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL54Q6P161 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL54Q6P161 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL54Q6P161 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL54Q6P161 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL54Q6P161 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL54Q6P161 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL54Q6P161 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL54Q6P161 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL54Q6P161 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL54Q6P161 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL54Q6P161 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL54Q6P161 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL54Q6P161 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL54Q6P161 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL54Q6P161 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL54Q6P161 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL54Q6P161 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL54Q6P161 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL54Q6P161 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL54Q6P161 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL54Q6P161 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL54Q6P161 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL54Q6P161 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL54Q6P161 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL54Q6P161 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL54Q6P161 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL54Q6P161 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL54Q6P161 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL54Q6P161 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL54Q6P161 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL54Q6P161 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL54Q6P161 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL54Q6P161 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL54Q6P161 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL54Q6P161 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL54Q6P161 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL54Q6P161 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL54Q6P161 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL54Q6P161 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL54Q6P161 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL54Q6P161 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL54Q6P161 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL54Q6P161 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL54Q6P161 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL54Q6P161 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL54Q6P161 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL54Q6P161 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL54Q6P161 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL54Q6P161 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL54Q6P161 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL54Q6P161 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL54Q6P161 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL54Q6P161 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL54Q6P161 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL54Q6P161 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL54Q6P161 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL54Q6P161 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL54Q6P161 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL54Q6P161 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL54Q6P161 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL54Q6P161 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL54Q6P161 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL54Q6P161 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL54Q6P161 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL54Q6P161 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL54Q6P161 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL54Q6P161 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL54Q6P161 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL54Q6P161 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL54Q6P161 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL54Q6P161 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL54Q6P161 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL54Q6P161 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL54Q6P161 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL54Q6P161 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL54Q6P161 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL54Q6P161 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL54Q6P161 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL54Q6P161 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL54Q6P161 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL54Q6P161 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms