Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KANK3Q6NY19 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KANK3Q6NY19 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KANK3Q6NY19 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KANK3Q6NY19 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KANK3Q6NY19 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KANK3Q6NY19 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KANK3Q6NY19 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KANK3Q6NY19 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KANK3Q6NY19 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KANK3Q6NY19 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KANK3Q6NY19 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KANK3Q6NY19 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KANK3Q6NY19 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KANK3Q6NY19 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KANK3Q6NY19 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KANK3Q6NY19 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KANK3Q6NY19 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KANK3Q6NY19 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KANK3Q6NY19 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KANK3Q6NY19 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KANK3Q6NY19 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KANK3Q6NY19 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KANK3Q6NY19 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KANK3Q6NY19 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KANK3Q6NY19 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KANK3Q6NY19 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KANK3Q6NY19 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KANK3Q6NY19 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KANK3Q6NY19 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KANK3Q6NY19 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
KANK3Q6NY19 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KANK3Q6NY19 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KANK3Q6NY19 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KANK3Q6NY19 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
KANK3Q6NY19 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
KANK3Q6NY19 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KANK3Q6NY19 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KANK3Q6NY19 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
KANK3Q6NY19 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KANK3Q6NY19 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
KANK3Q6NY19 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
KANK3Q6NY19 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KANK3Q6NY19 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KANK3Q6NY19 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KANK3Q6NY19 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
KANK3Q6NY19 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KANK3Q6NY19 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
KANK3Q6NY19 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KANK3Q6NY19 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KANK3Q6NY19 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KANK3Q6NY19 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KANK3Q6NY19 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
KANK3Q6NY19 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
KANK3Q6NY19 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
KANK3Q6NY19 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KANK3Q6NY19 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KANK3Q6NY19 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KANK3Q6NY19 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KANK3Q6NY19 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KANK3Q6NY19 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KANK3Q6NY19 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KANK3Q6NY19 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KANK3Q6NY19 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KANK3Q6NY19 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KANK3Q6NY19 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KANK3Q6NY19 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KANK3Q6NY19 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KANK3Q6NY19 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KANK3Q6NY19 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
KANK3Q6NY19 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
KANK3Q6NY19 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
KANK3Q6NY19 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KANK3Q6NY19 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KANK3Q6NY19 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KANK3Q6NY19 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KANK3Q6NY19 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KANK3Q6NY19 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KANK3Q6NY19 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KANK3Q6NY19 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KANK3Q6NY19 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KANK3Q6NY19 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KANK3Q6NY19 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KANK3Q6NY19 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KANK3Q6NY19 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KANK3Q6NY19 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KANK3Q6NY19 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KANK3Q6NY19 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KANK3Q6NY19 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KANK3Q6NY19 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KANK3Q6NY19 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
KANK3Q6NY19 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
KANK3Q6NY19 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
KANK3Q6NY19 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
KANK3Q6NY19 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KANK3Q6NY19 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KANK3Q6NY19 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
KANK3Q6NY19 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
KANK3Q6NY19 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KANK3Q6NY19 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms