Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEG0

SNRNP48, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 48 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP48Q6IEG0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SNRNP48Q6IEG0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SNRNP48Q6IEG0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SNRNP48Q6IEG0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SNRNP48Q6IEG0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SNRNP48Q6IEG0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SNRNP48Q6IEG0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SNRNP48Q6IEG0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SNRNP48Q6IEG0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SNRNP48Q6IEG0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SNRNP48Q6IEG0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNRNP48Q6IEG0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNRNP48Q6IEG0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SNRNP48Q6IEG0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SNRNP48Q6IEG0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SNRNP48Q6IEG0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SNRNP48Q6IEG0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SNRNP48Q6IEG0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SNRNP48Q6IEG0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SNRNP48Q6IEG0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SNRNP48Q6IEG0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SNRNP48Q6IEG0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SNRNP48Q6IEG0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SNRNP48Q6IEG0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SNRNP48Q6IEG0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SNRNP48Q6IEG0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SNRNP48Q6IEG0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SNRNP48Q6IEG0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SNRNP48Q6IEG0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SNRNP48Q6IEG0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SNRNP48Q6IEG0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SNRNP48Q6IEG0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
SNRNP48Q6IEG0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SNRNP48Q6IEG0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SNRNP48Q6IEG0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SNRNP48Q6IEG0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SNRNP48Q6IEG0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SNRNP48Q6IEG0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SNRNP48Q6IEG0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SNRNP48Q6IEG0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SNRNP48Q6IEG0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SNRNP48Q6IEG0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SNRNP48Q6IEG0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SNRNP48Q6IEG0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SNRNP48Q6IEG0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SNRNP48Q6IEG0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SNRNP48Q6IEG0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SNRNP48Q6IEG0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SNRNP48Q6IEG0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SNRNP48Q6IEG0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SNRNP48Q6IEG0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SNRNP48Q6IEG0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SNRNP48Q6IEG0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
SNRNP48Q6IEG0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNRNP48Q6IEG0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SNRNP48Q6IEG0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SNRNP48Q6IEG0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SNRNP48Q6IEG0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SNRNP48Q6IEG0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SNRNP48Q6IEG0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SNRNP48Q6IEG0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SNRNP48Q6IEG0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SNRNP48Q6IEG0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SNRNP48Q6IEG0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
SNRNP48Q6IEG0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SNRNP48Q6IEG0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SNRNP48Q6IEG0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SNRNP48Q6IEG0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SNRNP48Q6IEG0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SNRNP48Q6IEG0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SNRNP48Q6IEG0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SNRNP48Q6IEG0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SNRNP48Q6IEG0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SNRNP48Q6IEG0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SNRNP48Q6IEG0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SNRNP48Q6IEG0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SNRNP48Q6IEG0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SNRNP48Q6IEG0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SNRNP48Q6IEG0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SNRNP48Q6IEG0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SNRNP48Q6IEG0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SNRNP48Q6IEG0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SNRNP48Q6IEG0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SNRNP48Q6IEG0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SNRNP48Q6IEG0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SNRNP48Q6IEG0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SNRNP48Q6IEG0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SNRNP48Q6IEG0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SNRNP48Q6IEG0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SNRNP48Q6IEG0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SNRNP48Q6IEG0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SNRNP48Q6IEG0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SNRNP48Q6IEG0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SNRNP48Q6IEG0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SNRNP48Q6IEG0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SNRNP48Q6IEG0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SNRNP48Q6IEG0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SNRNP48Q6IEG0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SNRNP48Q6IEG0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SNRNP48Q6IEG0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 498.8 ms