Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMK4

VASN, Vasorin, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASNQ6EMK4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VASNQ6EMK4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VASNQ6EMK4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VASNQ6EMK4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VASNQ6EMK4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VASNQ6EMK4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VASNQ6EMK4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VASNQ6EMK4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VASNQ6EMK4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VASNQ6EMK4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VASNQ6EMK4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VASNQ6EMK4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VASNQ6EMK4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VASNQ6EMK4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VASNQ6EMK4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VASNQ6EMK4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VASNQ6EMK4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VASNQ6EMK4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VASNQ6EMK4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VASNQ6EMK4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VASNQ6EMK4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VASNQ6EMK4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VASNQ6EMK4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VASNQ6EMK4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VASNQ6EMK4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VASNQ6EMK4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VASNQ6EMK4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VASNQ6EMK4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VASNQ6EMK4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VASNQ6EMK4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VASNQ6EMK4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VASNQ6EMK4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VASNQ6EMK4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VASNQ6EMK4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VASNQ6EMK4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VASNQ6EMK4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VASNQ6EMK4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VASNQ6EMK4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VASNQ6EMK4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VASNQ6EMK4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VASNQ6EMK4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VASNQ6EMK4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VASNQ6EMK4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VASNQ6EMK4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VASNQ6EMK4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VASNQ6EMK4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VASNQ6EMK4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VASNQ6EMK4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VASNQ6EMK4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VASNQ6EMK4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VASNQ6EMK4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VASNQ6EMK4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VASNQ6EMK4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VASNQ6EMK4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VASNQ6EMK4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VASNQ6EMK4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VASNQ6EMK4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VASNQ6EMK4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VASNQ6EMK4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VASNQ6EMK4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VASNQ6EMK4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VASNQ6EMK4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VASNQ6EMK4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VASNQ6EMK4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VASNQ6EMK4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VASNQ6EMK4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VASNQ6EMK4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VASNQ6EMK4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VASNQ6EMK4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VASNQ6EMK4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VASNQ6EMK4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VASNQ6EMK4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VASNQ6EMK4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VASNQ6EMK4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VASNQ6EMK4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VASNQ6EMK4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VASNQ6EMK4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VASNQ6EMK4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VASNQ6EMK4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VASNQ6EMK4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VASNQ6EMK4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VASNQ6EMK4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VASNQ6EMK4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VASNQ6EMK4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VASNQ6EMK4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VASNQ6EMK4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VASNQ6EMK4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VASNQ6EMK4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VASNQ6EMK4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VASNQ6EMK4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VASNQ6EMK4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VASNQ6EMK4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VASNQ6EMK4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VASNQ6EMK4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VASNQ6EMK4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VASNQ6EMK4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VASNQ6EMK4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VASNQ6EMK4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VASNQ6EMK4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VASNQ6EMK4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms