Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF220Q5VTB9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF220Q5VTB9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF220Q5VTB9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF220Q5VTB9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF220Q5VTB9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF220Q5VTB9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF220Q5VTB9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF220Q5VTB9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF220Q5VTB9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF220Q5VTB9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF220Q5VTB9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF220Q5VTB9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF220Q5VTB9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF220Q5VTB9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF220Q5VTB9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF220Q5VTB9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF220Q5VTB9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF220Q5VTB9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF220Q5VTB9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF220Q5VTB9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF220Q5VTB9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF220Q5VTB9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF220Q5VTB9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF220Q5VTB9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF220Q5VTB9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF220Q5VTB9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF220Q5VTB9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF220Q5VTB9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF220Q5VTB9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF220Q5VTB9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF220Q5VTB9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF220Q5VTB9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF220Q5VTB9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF220Q5VTB9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF220Q5VTB9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF220Q5VTB9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF220Q5VTB9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF220Q5VTB9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF220Q5VTB9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF220Q5VTB9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF220Q5VTB9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF220Q5VTB9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF220Q5VTB9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF220Q5VTB9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF220Q5VTB9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF220Q5VTB9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF220Q5VTB9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF220Q5VTB9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF220Q5VTB9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF220Q5VTB9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF220Q5VTB9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF220Q5VTB9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF220Q5VTB9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF220Q5VTB9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF220Q5VTB9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF220Q5VTB9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF220Q5VTB9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF220Q5VTB9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF220Q5VTB9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF220Q5VTB9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF220Q5VTB9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF220Q5VTB9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF220Q5VTB9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF220Q5VTB9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF220Q5VTB9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF220Q5VTB9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF220Q5VTB9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF220Q5VTB9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF220Q5VTB9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF220Q5VTB9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF220Q5VTB9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF220Q5VTB9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF220Q5VTB9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF220Q5VTB9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF220Q5VTB9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF220Q5VTB9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF220Q5VTB9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF220Q5VTB9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF220Q5VTB9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF220Q5VTB9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF220Q5VTB9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF220Q5VTB9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF220Q5VTB9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF220Q5VTB9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF220Q5VTB9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF220Q5VTB9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF220Q5VTB9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF220Q5VTB9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF220Q5VTB9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF220Q5VTB9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF220Q5VTB9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF220Q5VTB9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF220Q5VTB9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF220Q5VTB9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF220Q5VTB9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF220Q5VTB9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF220Q5VTB9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF220Q5VTB9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF220Q5VTB9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms