Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM78BQ5VT40 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM78BQ5VT40 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM78BQ5VT40 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM78BQ5VT40 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM78BQ5VT40 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM78BQ5VT40 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM78BQ5VT40 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM78BQ5VT40 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM78BQ5VT40 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM78BQ5VT40 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM78BQ5VT40 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM78BQ5VT40 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM78BQ5VT40 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM78BQ5VT40 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM78BQ5VT40 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM78BQ5VT40 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM78BQ5VT40 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM78BQ5VT40 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM78BQ5VT40 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM78BQ5VT40 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM78BQ5VT40 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM78BQ5VT40 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM78BQ5VT40 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM78BQ5VT40 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM78BQ5VT40 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM78BQ5VT40 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM78BQ5VT40 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM78BQ5VT40 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM78BQ5VT40 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM78BQ5VT40 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM78BQ5VT40 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM78BQ5VT40 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM78BQ5VT40 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM78BQ5VT40 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM78BQ5VT40 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM78BQ5VT40 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM78BQ5VT40 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM78BQ5VT40 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM78BQ5VT40 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM78BQ5VT40 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM78BQ5VT40 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM78BQ5VT40 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM78BQ5VT40 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM78BQ5VT40 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM78BQ5VT40 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM78BQ5VT40 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM78BQ5VT40 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM78BQ5VT40 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM78BQ5VT40 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM78BQ5VT40 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM78BQ5VT40 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM78BQ5VT40 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM78BQ5VT40 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM78BQ5VT40 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM78BQ5VT40 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM78BQ5VT40 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM78BQ5VT40 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM78BQ5VT40 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM78BQ5VT40 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM78BQ5VT40 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM78BQ5VT40 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM78BQ5VT40 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM78BQ5VT40 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM78BQ5VT40 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM78BQ5VT40 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM78BQ5VT40 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM78BQ5VT40 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM78BQ5VT40 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM78BQ5VT40 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM78BQ5VT40 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM78BQ5VT40 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM78BQ5VT40 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM78BQ5VT40 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM78BQ5VT40 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM78BQ5VT40 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM78BQ5VT40 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM78BQ5VT40 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM78BQ5VT40 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM78BQ5VT40 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM78BQ5VT40 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM78BQ5VT40 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM78BQ5VT40 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM78BQ5VT40 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM78BQ5VT40 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM78BQ5VT40 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM78BQ5VT40 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM78BQ5VT40 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM78BQ5VT40 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM78BQ5VT40 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM78BQ5VT40 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM78BQ5VT40 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM78BQ5VT40 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM78BQ5VT40 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM78BQ5VT40 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM78BQ5VT40 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM78BQ5VT40 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM78BQ5VT40 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM78BQ5VT40 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms