Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CEP350Q5VT06 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CEP350Q5VT06 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CEP350Q5VT06 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CEP350Q5VT06 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP350Q5VT06 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP350Q5VT06 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CEP350Q5VT06 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CEP350Q5VT06 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CEP350Q5VT06 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CEP350Q5VT06 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CEP350Q5VT06 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CEP350Q5VT06 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CEP350Q5VT06 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CEP350Q5VT06 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CEP350Q5VT06 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CEP350Q5VT06 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CEP350Q5VT06 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CEP350Q5VT06 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CEP350Q5VT06 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CEP350Q5VT06 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.3
CEP350Q5VT06 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CEP350Q5VT06 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CEP350Q5VT06 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CEP350Q5VT06 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
CEP350Q5VT06 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CEP350Q5VT06 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
CEP350Q5VT06 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CEP350Q5VT06 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CEP350Q5VT06 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CEP350Q5VT06 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CEP350Q5VT06 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
CEP350Q5VT06 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CEP350Q5VT06 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CEP350Q5VT06 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CEP350Q5VT06 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CEP350Q5VT06 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CEP350Q5VT06 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CEP350Q5VT06 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CEP350Q5VT06 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CEP350Q5VT06 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CEP350Q5VT06 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CEP350Q5VT06 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CEP350Q5VT06 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CEP350Q5VT06 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP350Q5VT06 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP350Q5VT06 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CEP350Q5VT06 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CEP350Q5VT06 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CEP350Q5VT06 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CEP350Q5VT06 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CEP350Q5VT06 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP350Q5VT06 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP350Q5VT06 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP350Q5VT06 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP350Q5VT06 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP350Q5VT06 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP350Q5VT06 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CEP350Q5VT06 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CEP350Q5VT06 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CEP350Q5VT06 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CEP350Q5VT06 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CEP350Q5VT06 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CEP350Q5VT06 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CEP350Q5VT06 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CEP350Q5VT06 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CEP350Q5VT06 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CEP350Q5VT06 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CEP350Q5VT06 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CEP350Q5VT06 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP350Q5VT06 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP350Q5VT06 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP350Q5VT06 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CEP350Q5VT06 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CEP350Q5VT06 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CEP350Q5VT06 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CEP350Q5VT06 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP350Q5VT06 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP350Q5VT06 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP350Q5VT06 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP350Q5VT06 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP350Q5VT06 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CEP350Q5VT06 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CEP350Q5VT06 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CEP350Q5VT06 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CEP350Q5VT06 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CEP350Q5VT06 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP350Q5VT06 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP350Q5VT06 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP350Q5VT06 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CEP350Q5VT06 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP350Q5VT06 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP350Q5VT06 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP350Q5VT06 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP350Q5VT06 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CEP350Q5VT06 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CEP350Q5VT06 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CEP350Q5VT06 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CEP350Q5VT06 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CEP350Q5VT06 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms