Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL22Q53GT1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL22Q53GT1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL22Q53GT1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL22Q53GT1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL22Q53GT1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL22Q53GT1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL22Q53GT1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL22Q53GT1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL22Q53GT1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL22Q53GT1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL22Q53GT1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL22Q53GT1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL22Q53GT1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL22Q53GT1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL22Q53GT1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL22Q53GT1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL22Q53GT1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL22Q53GT1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL22Q53GT1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL22Q53GT1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL22Q53GT1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL22Q53GT1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL22Q53GT1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL22Q53GT1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL22Q53GT1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL22Q53GT1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL22Q53GT1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL22Q53GT1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL22Q53GT1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL22Q53GT1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL22Q53GT1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL22Q53GT1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL22Q53GT1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL22Q53GT1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL22Q53GT1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL22Q53GT1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL22Q53GT1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL22Q53GT1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL22Q53GT1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL22Q53GT1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL22Q53GT1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL22Q53GT1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL22Q53GT1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL22Q53GT1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL22Q53GT1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL22Q53GT1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL22Q53GT1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL22Q53GT1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL22Q53GT1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL22Q53GT1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL22Q53GT1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL22Q53GT1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHL22Q53GT1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL22Q53GT1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL22Q53GT1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL22Q53GT1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL22Q53GT1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL22Q53GT1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL22Q53GT1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL22Q53GT1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL22Q53GT1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL22Q53GT1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL22Q53GT1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL22Q53GT1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL22Q53GT1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL22Q53GT1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL22Q53GT1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL22Q53GT1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL22Q53GT1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL22Q53GT1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL22Q53GT1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL22Q53GT1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL22Q53GT1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL22Q53GT1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL22Q53GT1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL22Q53GT1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL22Q53GT1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL22Q53GT1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL22Q53GT1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL22Q53GT1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL22Q53GT1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL22Q53GT1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL22Q53GT1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL22Q53GT1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL22Q53GT1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL22Q53GT1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL22Q53GT1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL22Q53GT1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL22Q53GT1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL22Q53GT1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL22Q53GT1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL22Q53GT1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL22Q53GT1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL22Q53GT1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL22Q53GT1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL22Q53GT1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL22Q53GT1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL22Q53GT1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL22Q53GT1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms