Protein–RNA interactions for Protein: Q4AC94

C2CD3, C2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD3Q4AC94 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2CD3Q4AC94 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2CD3Q4AC94 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C2CD3Q4AC94 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2CD3Q4AC94 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2CD3Q4AC94 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2CD3Q4AC94 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2CD3Q4AC94 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2CD3Q4AC94 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C2CD3Q4AC94 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C2CD3Q4AC94 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD3Q4AC94 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD3Q4AC94 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD3Q4AC94 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2CD3Q4AC94 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2CD3Q4AC94 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2CD3Q4AC94 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2CD3Q4AC94 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C2CD3Q4AC94 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C2CD3Q4AC94 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2CD3Q4AC94 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2CD3Q4AC94 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C2CD3Q4AC94 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C2CD3Q4AC94 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2CD3Q4AC94 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2CD3Q4AC94 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C2CD3Q4AC94 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2CD3Q4AC94 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C2CD3Q4AC94 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2CD3Q4AC94 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2CD3Q4AC94 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2CD3Q4AC94 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2CD3Q4AC94 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2CD3Q4AC94 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2CD3Q4AC94 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2CD3Q4AC94 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2CD3Q4AC94 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD3Q4AC94 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD3Q4AC94 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD3Q4AC94 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C2CD3Q4AC94 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD3Q4AC94 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD3Q4AC94 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2CD3Q4AC94 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2CD3Q4AC94 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2CD3Q4AC94 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2CD3Q4AC94 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2CD3Q4AC94 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2CD3Q4AC94 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C2CD3Q4AC94 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2CD3Q4AC94 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2CD3Q4AC94 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2CD3Q4AC94 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2CD3Q4AC94 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2CD3Q4AC94 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2CD3Q4AC94 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2CD3Q4AC94 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2CD3Q4AC94 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2CD3Q4AC94 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2CD3Q4AC94 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C2CD3Q4AC94 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C2CD3Q4AC94 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C2CD3Q4AC94 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2CD3Q4AC94 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C2CD3Q4AC94 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C2CD3Q4AC94 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C2CD3Q4AC94 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C2CD3Q4AC94 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2CD3Q4AC94 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C2CD3Q4AC94 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C2CD3Q4AC94 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C2CD3Q4AC94 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2CD3Q4AC94 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2CD3Q4AC94 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2CD3Q4AC94 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2CD3Q4AC94 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2CD3Q4AC94 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2CD3Q4AC94 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2CD3Q4AC94 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2CD3Q4AC94 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2CD3Q4AC94 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2CD3Q4AC94 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C2CD3Q4AC94 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2CD3Q4AC94 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2CD3Q4AC94 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C2CD3Q4AC94 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2CD3Q4AC94 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2CD3Q4AC94 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2CD3Q4AC94 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2CD3Q4AC94 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C2CD3Q4AC94 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2CD3Q4AC94 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C2CD3Q4AC94 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C2CD3Q4AC94 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C2CD3Q4AC94 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2CD3Q4AC94 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2CD3Q4AC94 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2CD3Q4AC94 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2CD3Q4AC94 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2CD3Q4AC94 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms