Protein–RNA interactions for Protein: Q49A17

GALNTL6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 6, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNTL6Q49A17 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GALNTL6Q49A17 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GALNTL6Q49A17 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GALNTL6Q49A17 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GALNTL6Q49A17 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GALNTL6Q49A17 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GALNTL6Q49A17 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GALNTL6Q49A17 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GALNTL6Q49A17 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GALNTL6Q49A17 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GALNTL6Q49A17 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GALNTL6Q49A17 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GALNTL6Q49A17 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GALNTL6Q49A17 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GALNTL6Q49A17 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GALNTL6Q49A17 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GALNTL6Q49A17 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GALNTL6Q49A17 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GALNTL6Q49A17 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GALNTL6Q49A17 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GALNTL6Q49A17 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GALNTL6Q49A17 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GALNTL6Q49A17 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GALNTL6Q49A17 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GALNTL6Q49A17 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GALNTL6Q49A17 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GALNTL6Q49A17 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GALNTL6Q49A17 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GALNTL6Q49A17 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GALNTL6Q49A17 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GALNTL6Q49A17 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GALNTL6Q49A17 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GALNTL6Q49A17 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GALNTL6Q49A17 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GALNTL6Q49A17 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GALNTL6Q49A17 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GALNTL6Q49A17 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GALNTL6Q49A17 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GALNTL6Q49A17 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GALNTL6Q49A17 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GALNTL6Q49A17 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GALNTL6Q49A17 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GALNTL6Q49A17 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GALNTL6Q49A17 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GALNTL6Q49A17 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GALNTL6Q49A17 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GALNTL6Q49A17 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GALNTL6Q49A17 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GALNTL6Q49A17 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GALNTL6Q49A17 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GALNTL6Q49A17 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GALNTL6Q49A17 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GALNTL6Q49A17 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GALNTL6Q49A17 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GALNTL6Q49A17 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GALNTL6Q49A17 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GALNTL6Q49A17 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GALNTL6Q49A17 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GALNTL6Q49A17 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GALNTL6Q49A17 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GALNTL6Q49A17 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GALNTL6Q49A17 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GALNTL6Q49A17 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GALNTL6Q49A17 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GALNTL6Q49A17 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GALNTL6Q49A17 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GALNTL6Q49A17 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GALNTL6Q49A17 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GALNTL6Q49A17 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GALNTL6Q49A17 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GALNTL6Q49A17 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GALNTL6Q49A17 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GALNTL6Q49A17 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GALNTL6Q49A17 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GALNTL6Q49A17 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GALNTL6Q49A17 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GALNTL6Q49A17 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GALNTL6Q49A17 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GALNTL6Q49A17 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GALNTL6Q49A17 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GALNTL6Q49A17 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GALNTL6Q49A17 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GALNTL6Q49A17 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GALNTL6Q49A17 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GALNTL6Q49A17 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GALNTL6Q49A17 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GALNTL6Q49A17 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GALNTL6Q49A17 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GALNTL6Q49A17 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GALNTL6Q49A17 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GALNTL6Q49A17 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GALNTL6Q49A17 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GALNTL6Q49A17 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GALNTL6Q49A17 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GALNTL6Q49A17 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GALNTL6Q49A17 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GALNTL6Q49A17 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GALNTL6Q49A17 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GALNTL6Q49A17 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GALNTL6Q49A17 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms