Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1FQ16864 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1FQ16864 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1FQ16864 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1FQ16864 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1FQ16864 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1FQ16864 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1FQ16864 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1FQ16864 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1FQ16864 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1FQ16864 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1FQ16864 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1FQ16864 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1FQ16864 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1FQ16864 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6V1FQ16864 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6V1FQ16864 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6V1FQ16864 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1FQ16864 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1FQ16864 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1FQ16864 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1FQ16864 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1FQ16864 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1FQ16864 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1FQ16864 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1FQ16864 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1FQ16864 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1FQ16864 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1FQ16864 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1FQ16864 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1FQ16864 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1FQ16864 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1FQ16864 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1FQ16864 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP6V1FQ16864 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1FQ16864 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1FQ16864 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1FQ16864 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1FQ16864 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1FQ16864 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1FQ16864 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1FQ16864 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP6V1FQ16864 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1FQ16864 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1FQ16864 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1FQ16864 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1FQ16864 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1FQ16864 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1FQ16864 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1FQ16864 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1FQ16864 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1FQ16864 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1FQ16864 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6V1FQ16864 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1FQ16864 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1FQ16864 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1FQ16864 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1FQ16864 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1FQ16864 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1FQ16864 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP6V1FQ16864 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1FQ16864 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1FQ16864 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1FQ16864 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1FQ16864 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1FQ16864 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1FQ16864 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1FQ16864 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1FQ16864 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1FQ16864 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1FQ16864 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1FQ16864 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1FQ16864 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1FQ16864 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1FQ16864 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1FQ16864 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1FQ16864 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1FQ16864 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1FQ16864 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1FQ16864 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1FQ16864 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1FQ16864 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6V1FQ16864 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6V1FQ16864 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1FQ16864 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1FQ16864 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1FQ16864 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1FQ16864 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1FQ16864 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1FQ16864 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1FQ16864 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1FQ16864 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1FQ16864 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1FQ16864 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1FQ16864 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1FQ16864 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1FQ16864 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1FQ16864 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1FQ16864 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1FQ16864 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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