Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NTRK2Q16620 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NTRK2Q16620 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTRK2Q16620 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTRK2Q16620 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NTRK2Q16620 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK2Q16620 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK2Q16620 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK2Q16620 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK2Q16620 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTRK2Q16620 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTRK2Q16620 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK2Q16620 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK2Q16620 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK2Q16620 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK2Q16620 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK2Q16620 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NTRK2Q16620 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NTRK2Q16620 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NTRK2Q16620 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NTRK2Q16620 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NTRK2Q16620 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NTRK2Q16620 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NTRK2Q16620 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NTRK2Q16620 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NTRK2Q16620 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NTRK2Q16620 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NTRK2Q16620 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NTRK2Q16620 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NTRK2Q16620 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NTRK2Q16620 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NTRK2Q16620 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NTRK2Q16620 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NTRK2Q16620 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NTRK2Q16620 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NTRK2Q16620 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NTRK2Q16620 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NTRK2Q16620 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NTRK2Q16620 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NTRK2Q16620 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NTRK2Q16620 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NTRK2Q16620 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK2Q16620 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK2Q16620 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NTRK2Q16620 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NTRK2Q16620 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NTRK2Q16620 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NTRK2Q16620 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NTRK2Q16620 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NTRK2Q16620 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NTRK2Q16620 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NTRK2Q16620 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NTRK2Q16620 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NTRK2Q16620 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NTRK2Q16620 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NTRK2Q16620 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NTRK2Q16620 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NTRK2Q16620 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NTRK2Q16620 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NTRK2Q16620 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NTRK2Q16620 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NTRK2Q16620 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NTRK2Q16620 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NTRK2Q16620 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NTRK2Q16620 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTRK2Q16620 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTRK2Q16620 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTRK2Q16620 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTRK2Q16620 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTRK2Q16620 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTRK2Q16620 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTRK2Q16620 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTRK2Q16620 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NTRK2Q16620 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTRK2Q16620 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTRK2Q16620 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTRK2Q16620 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTRK2Q16620 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTRK2Q16620 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK2Q16620 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTRK2Q16620 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTRK2Q16620 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK2Q16620 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTRK2Q16620 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NTRK2Q16620 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NTRK2Q16620 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK2Q16620 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTRK2Q16620 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NTRK2Q16620 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK2Q16620 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK2Q16620 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK2Q16620 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTRK2Q16620 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTRK2Q16620 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NTRK2Q16620 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NTRK2Q16620 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NTRK2Q16620 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NTRK2Q16620 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NTRK2Q16620 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NTRK2Q16620 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms