Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FXNQ16595 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FXNQ16595 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FXNQ16595 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FXNQ16595 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FXNQ16595 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FXNQ16595 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FXNQ16595 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FXNQ16595 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FXNQ16595 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FXNQ16595 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FXNQ16595 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FXNQ16595 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FXNQ16595 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FXNQ16595 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FXNQ16595 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FXNQ16595 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FXNQ16595 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FXNQ16595 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FXNQ16595 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FXNQ16595 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FXNQ16595 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FXNQ16595 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FXNQ16595 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FXNQ16595 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FXNQ16595 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FXNQ16595 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FXNQ16595 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FXNQ16595 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FXNQ16595 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FXNQ16595 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FXNQ16595 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FXNQ16595 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FXNQ16595 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FXNQ16595 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FXNQ16595 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FXNQ16595 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FXNQ16595 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FXNQ16595 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FXNQ16595 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FXNQ16595 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FXNQ16595 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FXNQ16595 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FXNQ16595 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FXNQ16595 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FXNQ16595 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FXNQ16595 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FXNQ16595 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FXNQ16595 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FXNQ16595 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FXNQ16595 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FXNQ16595 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FXNQ16595 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FXNQ16595 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FXNQ16595 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FXNQ16595 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FXNQ16595 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FXNQ16595 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FXNQ16595 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FXNQ16595 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FXNQ16595 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FXNQ16595 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FXNQ16595 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FXNQ16595 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FXNQ16595 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FXNQ16595 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FXNQ16595 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FXNQ16595 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FXNQ16595 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FXNQ16595 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FXNQ16595 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FXNQ16595 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FXNQ16595 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FXNQ16595 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FXNQ16595 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FXNQ16595 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FXNQ16595 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FXNQ16595 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FXNQ16595 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FXNQ16595 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FXNQ16595 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FXNQ16595 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FXNQ16595 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FXNQ16595 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FXNQ16595 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FXNQ16595 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FXNQ16595 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FXNQ16595 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FXNQ16595 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FXNQ16595 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FXNQ16595 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FXNQ16595 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FXNQ16595 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FXNQ16595 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FXNQ16595 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FXNQ16595 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FXNQ16595 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FXNQ16595 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FXNQ16595 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FXNQ16595 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
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