Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRR4Q16378 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRR4Q16378 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRR4Q16378 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRR4Q16378 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRR4Q16378 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRR4Q16378 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRR4Q16378 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRR4Q16378 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRR4Q16378 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRR4Q16378 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRR4Q16378 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRR4Q16378 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRR4Q16378 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRR4Q16378 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRR4Q16378 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRR4Q16378 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRR4Q16378 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRR4Q16378 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRR4Q16378 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRR4Q16378 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRR4Q16378 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRR4Q16378 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRR4Q16378 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRR4Q16378 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRR4Q16378 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRR4Q16378 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRR4Q16378 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRR4Q16378 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR4Q16378 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR4Q16378 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR4Q16378 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRR4Q16378 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR4Q16378 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRR4Q16378 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRR4Q16378 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRR4Q16378 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRR4Q16378 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRR4Q16378 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRR4Q16378 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRR4Q16378 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRR4Q16378 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRR4Q16378 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRR4Q16378 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRR4Q16378 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRR4Q16378 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRR4Q16378 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRR4Q16378 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRR4Q16378 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRR4Q16378 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRR4Q16378 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRR4Q16378 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRR4Q16378 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRR4Q16378 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRR4Q16378 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRR4Q16378 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRR4Q16378 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRR4Q16378 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRR4Q16378 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRR4Q16378 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRR4Q16378 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRR4Q16378 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRR4Q16378 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRR4Q16378 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRR4Q16378 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRR4Q16378 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRR4Q16378 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRR4Q16378 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRR4Q16378 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRR4Q16378 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRR4Q16378 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRR4Q16378 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRR4Q16378 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRR4Q16378 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRR4Q16378 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRR4Q16378 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRR4Q16378 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRR4Q16378 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRR4Q16378 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRR4Q16378 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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