Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NEDD8Q15843 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD8Q15843 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD8Q15843 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD8Q15843 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD8Q15843 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD8Q15843 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD8Q15843 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD8Q15843 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD8Q15843 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD8Q15843 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD8Q15843 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD8Q15843 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD8Q15843 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD8Q15843 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD8Q15843 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD8Q15843 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD8Q15843 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD8Q15843 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD8Q15843 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD8Q15843 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD8Q15843 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEDD8Q15843 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD8Q15843 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEDD8Q15843 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEDD8Q15843 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEDD8Q15843 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD8Q15843 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD8Q15843 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEDD8Q15843 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD8Q15843 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD8Q15843 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD8Q15843 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD8Q15843 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD8Q15843 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD8Q15843 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD8Q15843 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD8Q15843 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD8Q15843 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD8Q15843 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEDD8Q15843 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD8Q15843 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD8Q15843 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD8Q15843 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD8Q15843 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD8Q15843 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD8Q15843 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD8Q15843 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD8Q15843 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD8Q15843 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD8Q15843 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD8Q15843 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD8Q15843 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD8Q15843 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD8Q15843 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD8Q15843 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD8Q15843 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD8Q15843 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD8Q15843 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD8Q15843 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD8Q15843 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD8Q15843 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD8Q15843 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD8Q15843 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD8Q15843 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD8Q15843 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD8Q15843 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD8Q15843 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD8Q15843 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD8Q15843 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD8Q15843 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD8Q15843 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD8Q15843 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD8Q15843 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD8Q15843 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD8Q15843 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD8Q15843 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD8Q15843 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD8Q15843 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD8Q15843 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD8Q15843 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEDD8Q15843 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD8Q15843 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD8Q15843 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD8Q15843 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD8Q15843 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD8Q15843 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD8Q15843 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD8Q15843 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD8Q15843 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD8Q15843 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD8Q15843 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD8Q15843 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD8Q15843 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD8Q15843 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD8Q15843 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD8Q15843 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD8Q15843 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD8Q15843 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD8Q15843 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
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