Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDSNQ15517 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDSNQ15517 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDSNQ15517 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDSNQ15517 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDSNQ15517 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDSNQ15517 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDSNQ15517 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDSNQ15517 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDSNQ15517 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDSNQ15517 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDSNQ15517 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDSNQ15517 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDSNQ15517 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDSNQ15517 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDSNQ15517 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDSNQ15517 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDSNQ15517 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDSNQ15517 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDSNQ15517 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDSNQ15517 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDSNQ15517 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDSNQ15517 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDSNQ15517 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDSNQ15517 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDSNQ15517 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDSNQ15517 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDSNQ15517 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDSNQ15517 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDSNQ15517 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDSNQ15517 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDSNQ15517 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDSNQ15517 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDSNQ15517 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDSNQ15517 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDSNQ15517 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDSNQ15517 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDSNQ15517 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDSNQ15517 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDSNQ15517 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDSNQ15517 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDSNQ15517 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDSNQ15517 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDSNQ15517 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDSNQ15517 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDSNQ15517 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDSNQ15517 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDSNQ15517 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDSNQ15517 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDSNQ15517 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDSNQ15517 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDSNQ15517 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDSNQ15517 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDSNQ15517 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDSNQ15517 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDSNQ15517 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDSNQ15517 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDSNQ15517 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDSNQ15517 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDSNQ15517 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDSNQ15517 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDSNQ15517 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDSNQ15517 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDSNQ15517 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDSNQ15517 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDSNQ15517 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDSNQ15517 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDSNQ15517 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDSNQ15517 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDSNQ15517 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDSNQ15517 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDSNQ15517 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDSNQ15517 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDSNQ15517 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDSNQ15517 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDSNQ15517 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDSNQ15517 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDSNQ15517 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDSNQ15517 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDSNQ15517 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDSNQ15517 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDSNQ15517 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDSNQ15517 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDSNQ15517 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDSNQ15517 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDSNQ15517 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDSNQ15517 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDSNQ15517 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDSNQ15517 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDSNQ15517 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDSNQ15517 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDSNQ15517 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDSNQ15517 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDSNQ15517 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDSNQ15517 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDSNQ15517 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDSNQ15517 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDSNQ15517 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDSNQ15517 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDSNQ15517 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
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