Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PLS1Q14651 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PLS1Q14651 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLS1Q14651 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PLS1Q14651 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PLS1Q14651 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLS1Q14651 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PLS1Q14651 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PLS1Q14651 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PLS1Q14651 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PLS1Q14651 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PLS1Q14651 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PLS1Q14651 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PLS1Q14651 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PLS1Q14651 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PLS1Q14651 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PLS1Q14651 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PLS1Q14651 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PLS1Q14651 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PLS1Q14651 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PLS1Q14651 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PLS1Q14651 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PLS1Q14651 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PLS1Q14651 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PLS1Q14651 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PLS1Q14651 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PLS1Q14651 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PLS1Q14651 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PLS1Q14651 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PLS1Q14651 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PLS1Q14651 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PLS1Q14651 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PLS1Q14651 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PLS1Q14651 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PLS1Q14651 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PLS1Q14651 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PLS1Q14651 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PLS1Q14651 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PLS1Q14651 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PLS1Q14651 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PLS1Q14651 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PLS1Q14651 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PLS1Q14651 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PLS1Q14651 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PLS1Q14651 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PLS1Q14651 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PLS1Q14651 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PLS1Q14651 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PLS1Q14651 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PLS1Q14651 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PLS1Q14651 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PLS1Q14651 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PLS1Q14651 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PLS1Q14651 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PLS1Q14651 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PLS1Q14651 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PLS1Q14651 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PLS1Q14651 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PLS1Q14651 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PLS1Q14651 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PLS1Q14651 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PLS1Q14651 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PLS1Q14651 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PLS1Q14651 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PLS1Q14651 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PLS1Q14651 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PLS1Q14651 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PLS1Q14651 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PLS1Q14651 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PLS1Q14651 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PLS1Q14651 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PLS1Q14651 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PLS1Q14651 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PLS1Q14651 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PLS1Q14651 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PLS1Q14651 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PLS1Q14651 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PLS1Q14651 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PLS1Q14651 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PLS1Q14651 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PLS1Q14651 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PLS1Q14651 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PLS1Q14651 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PLS1Q14651 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PLS1Q14651 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PLS1Q14651 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PLS1Q14651 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PLS1Q14651 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PLS1Q14651 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PLS1Q14651 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PLS1Q14651 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PLS1Q14651 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PLS1Q14651 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PLS1Q14651 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PLS1Q14651 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PLS1Q14651 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PLS1Q14651 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PLS1Q14651 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PLS1Q14651 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PLS1Q14651 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms