Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TNFAIP1Q13829 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TNFAIP1Q13829 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TNFAIP1Q13829 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TNFAIP1Q13829 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TNFAIP1Q13829 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TNFAIP1Q13829 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TNFAIP1Q13829 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNFAIP1Q13829 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNFAIP1Q13829 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TNFAIP1Q13829 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TNFAIP1Q13829 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TNFAIP1Q13829 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TNFAIP1Q13829 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TNFAIP1Q13829 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TNFAIP1Q13829 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TNFAIP1Q13829 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TNFAIP1Q13829 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TNFAIP1Q13829 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TNFAIP1Q13829 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TNFAIP1Q13829 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TNFAIP1Q13829 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNFAIP1Q13829 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNFAIP1Q13829 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNFAIP1Q13829 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNFAIP1Q13829 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNFAIP1Q13829 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNFAIP1Q13829 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNFAIP1Q13829 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNFAIP1Q13829 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TNFAIP1Q13829 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNFAIP1Q13829 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNFAIP1Q13829 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNFAIP1Q13829 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNFAIP1Q13829 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNFAIP1Q13829 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TNFAIP1Q13829 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNFAIP1Q13829 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TNFAIP1Q13829 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNFAIP1Q13829 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
TNFAIP1Q13829 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNFAIP1Q13829 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNFAIP1Q13829 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNFAIP1Q13829 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNFAIP1Q13829 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TNFAIP1Q13829 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNFAIP1Q13829 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNFAIP1Q13829 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNFAIP1Q13829 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNFAIP1Q13829 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNFAIP1Q13829 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNFAIP1Q13829 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNFAIP1Q13829 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNFAIP1Q13829 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TNFAIP1Q13829 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNFAIP1Q13829 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNFAIP1Q13829 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNFAIP1Q13829 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNFAIP1Q13829 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNFAIP1Q13829 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNFAIP1Q13829 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNFAIP1Q13829 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNFAIP1Q13829 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNFAIP1Q13829 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNFAIP1Q13829 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNFAIP1Q13829 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNFAIP1Q13829 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNFAIP1Q13829 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNFAIP1Q13829 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNFAIP1Q13829 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TNFAIP1Q13829 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNFAIP1Q13829 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TNFAIP1Q13829 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TNFAIP1Q13829 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
TNFAIP1Q13829 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
TNFAIP1Q13829 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNFAIP1Q13829 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNFAIP1Q13829 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNFAIP1Q13829 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNFAIP1Q13829 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNFAIP1Q13829 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNFAIP1Q13829 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNFAIP1Q13829 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TNFAIP1Q13829 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TNFAIP1Q13829 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TNFAIP1Q13829 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.77■■■■□ 3
TNFAIP1Q13829 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNFAIP1Q13829 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNFAIP1Q13829 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNFAIP1Q13829 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNFAIP1Q13829 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNFAIP1Q13829 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNFAIP1Q13829 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TNFAIP1Q13829 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNFAIP1Q13829 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TNFAIP1Q13829 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNFAIP1Q13829 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNFAIP1Q13829 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNFAIP1Q13829 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
TNFAIP1Q13829 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
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