Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P11Q13670 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P11Q13670 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P11Q13670 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P11Q13670 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P11Q13670 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMS2P11Q13670 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P11Q13670 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P11Q13670 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P11Q13670 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P11Q13670 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P11Q13670 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS2P11Q13670 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS2P11Q13670 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS2P11Q13670 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PMS2P11Q13670 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS2P11Q13670 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS2P11Q13670 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS2P11Q13670 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMS2P11Q13670 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS2P11Q13670 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS2P11Q13670 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS2P11Q13670 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS2P11Q13670 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS2P11Q13670 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS2P11Q13670 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMS2P11Q13670 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMS2P11Q13670 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P11Q13670 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P11Q13670 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P11Q13670 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P11Q13670 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P11Q13670 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PMS2P11Q13670 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PMS2P11Q13670 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P11Q13670 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P11Q13670 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P11Q13670 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P11Q13670 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P11Q13670 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P11Q13670 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P11Q13670 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P11Q13670 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P11Q13670 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P11Q13670 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P11Q13670 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P11Q13670 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P11Q13670 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P11Q13670 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P11Q13670 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P11Q13670 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P11Q13670 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P11Q13670 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P11Q13670 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P11Q13670 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P11Q13670 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P11Q13670 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P11Q13670 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P11Q13670 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMS2P11Q13670 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P11Q13670 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P11Q13670 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P11Q13670 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P11Q13670 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P11Q13670 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P11Q13670 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P11Q13670 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P11Q13670 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P11Q13670 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P11Q13670 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P11Q13670 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P11Q13670 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P11Q13670 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P11Q13670 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P11Q13670 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P11Q13670 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P11Q13670 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P11Q13670 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P11Q13670 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P11Q13670 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P11Q13670 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P11Q13670 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P11Q13670 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P11Q13670 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P11Q13670 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P11Q13670 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P11Q13670 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P11Q13670 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P11Q13670 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P11Q13670 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMS2P11Q13670 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS2P11Q13670 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P11Q13670 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P11Q13670 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P11Q13670 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P11Q13670 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P11Q13670 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P11Q13670 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P11Q13670 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P11Q13670 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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