Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
MTMR3Q13615 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MTMR3Q13615 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MTMR3Q13615 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MTMR3Q13615 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MTMR3Q13615 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MTMR3Q13615 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
MTMR3Q13615 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MTMR3Q13615 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MTMR3Q13615 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MTMR3Q13615 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MTMR3Q13615 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
MTMR3Q13615 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MTMR3Q13615 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MTMR3Q13615 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MTMR3Q13615 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
MTMR3Q13615 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MTMR3Q13615 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MTMR3Q13615 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MTMR3Q13615 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MTMR3Q13615 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MTMR3Q13615 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MTMR3Q13615 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MTMR3Q13615 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MTMR3Q13615 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MTMR3Q13615 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MTMR3Q13615 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MTMR3Q13615 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MTMR3Q13615 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MTMR3Q13615 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MTMR3Q13615 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MTMR3Q13615 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
MTMR3Q13615 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MTMR3Q13615 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MTMR3Q13615 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MTMR3Q13615 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MTMR3Q13615 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MTMR3Q13615 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MTMR3Q13615 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MTMR3Q13615 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MTMR3Q13615 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
MTMR3Q13615 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MTMR3Q13615 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MTMR3Q13615 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MTMR3Q13615 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MTMR3Q13615 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MTMR3Q13615 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MTMR3Q13615 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MTMR3Q13615 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MTMR3Q13615 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MTMR3Q13615 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
MTMR3Q13615 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MTMR3Q13615 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MTMR3Q13615 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MTMR3Q13615 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MTMR3Q13615 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MTMR3Q13615 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MTMR3Q13615 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MTMR3Q13615 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MTMR3Q13615 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MTMR3Q13615 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MTMR3Q13615 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MTMR3Q13615 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MTMR3Q13615 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MTMR3Q13615 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MTMR3Q13615 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MTMR3Q13615 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MTMR3Q13615 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MTMR3Q13615 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
MTMR3Q13615 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MTMR3Q13615 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MTMR3Q13615 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MTMR3Q13615 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MTMR3Q13615 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MTMR3Q13615 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MTMR3Q13615 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
MTMR3Q13615 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MTMR3Q13615 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MTMR3Q13615 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MTMR3Q13615 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
MTMR3Q13615 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
MTMR3Q13615 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MTMR3Q13615 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
MTMR3Q13615 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MTMR3Q13615 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
MTMR3Q13615 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MTMR3Q13615 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MTMR3Q13615 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MTMR3Q13615 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MTMR3Q13615 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MTMR3Q13615 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MTMR3Q13615 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
MTMR3Q13615 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MTMR3Q13615 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MTMR3Q13615 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MTMR3Q13615 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MTMR3Q13615 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MTMR3Q13615 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MTMR3Q13615 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MTMR3Q13615 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
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