Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IKZF1Q13422 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IKZF1Q13422 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKZF1Q13422 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IKZF1Q13422 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKZF1Q13422 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKZF1Q13422 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKZF1Q13422 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IKZF1Q13422 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IKZF1Q13422 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKZF1Q13422 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKZF1Q13422 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IKZF1Q13422 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IKZF1Q13422 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IKZF1Q13422 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IKZF1Q13422 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IKZF1Q13422 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IKZF1Q13422 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IKZF1Q13422 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IKZF1Q13422 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IKZF1Q13422 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IKZF1Q13422 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IKZF1Q13422 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IKZF1Q13422 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKZF1Q13422 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IKZF1Q13422 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IKZF1Q13422 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKZF1Q13422 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKZF1Q13422 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKZF1Q13422 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IKZF1Q13422 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IKZF1Q13422 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IKZF1Q13422 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IKZF1Q13422 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IKZF1Q13422 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKZF1Q13422 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKZF1Q13422 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKZF1Q13422 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKZF1Q13422 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKZF1Q13422 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKZF1Q13422 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKZF1Q13422 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKZF1Q13422 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKZF1Q13422 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IKZF1Q13422 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKZF1Q13422 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKZF1Q13422 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKZF1Q13422 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKZF1Q13422 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKZF1Q13422 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF1Q13422 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF1Q13422 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKZF1Q13422 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF1Q13422 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKZF1Q13422 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms