Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IKZF1Q13422 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IKZF1Q13422 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKZF1Q13422 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IKZF1Q13422 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKZF1Q13422 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKZF1Q13422 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKZF1Q13422 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IKZF1Q13422 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IKZF1Q13422 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKZF1Q13422 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKZF1Q13422 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IKZF1Q13422 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IKZF1Q13422 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IKZF1Q13422 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IKZF1Q13422 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IKZF1Q13422 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IKZF1Q13422 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IKZF1Q13422 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IKZF1Q13422 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IKZF1Q13422 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IKZF1Q13422 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IKZF1Q13422 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IKZF1Q13422 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IKZF1Q13422 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKZF1Q13422 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IKZF1Q13422 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IKZF1Q13422 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKZF1Q13422 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKZF1Q13422 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKZF1Q13422 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IKZF1Q13422 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IKZF1Q13422 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IKZF1Q13422 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IKZF1Q13422 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IKZF1Q13422 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IKZF1Q13422 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKZF1Q13422 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKZF1Q13422 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKZF1Q13422 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKZF1Q13422 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKZF1Q13422 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKZF1Q13422 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKZF1Q13422 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKZF1Q13422 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKZF1Q13422 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IKZF1Q13422 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKZF1Q13422 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKZF1Q13422 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKZF1Q13422 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKZF1Q13422 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IKZF1Q13422 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IKZF1Q13422 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKZF1Q13422 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF1Q13422 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF1Q13422 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKZF1Q13422 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF1Q13422 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKZF1Q13422 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms