Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PAPPAQ13219 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PAPPAQ13219 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PAPPAQ13219 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PAPPAQ13219 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
PAPPAQ13219 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
PAPPAQ13219 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
PAPPAQ13219 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PAPPAQ13219 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PAPPAQ13219 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PAPPAQ13219 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PAPPAQ13219 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PAPPAQ13219 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PAPPAQ13219 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PAPPAQ13219 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PAPPAQ13219 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PAPPAQ13219 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PAPPAQ13219 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PAPPAQ13219 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PAPPAQ13219 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
PAPPAQ13219 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
PAPPAQ13219 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PAPPAQ13219 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PAPPAQ13219 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PAPPAQ13219 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
PAPPAQ13219 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PAPPAQ13219 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PAPPAQ13219 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC38■■■■□ 3.67
PAPPAQ13219 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38■■■■□ 3.67
PAPPAQ13219 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
PAPPAQ13219 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PAPPAQ13219 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
PAPPAQ13219 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PAPPAQ13219 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PAPPAQ13219 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PAPPAQ13219 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PAPPAQ13219 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PAPPAQ13219 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PAPPAQ13219 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PAPPAQ13219 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PAPPAQ13219 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PAPPAQ13219 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PAPPAQ13219 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PAPPAQ13219 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PAPPAQ13219 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PAPPAQ13219 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PAPPAQ13219 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PAPPAQ13219 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PAPPAQ13219 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PAPPAQ13219 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PAPPAQ13219 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PAPPAQ13219 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PAPPAQ13219 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PAPPAQ13219 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PAPPAQ13219 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PAPPAQ13219 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PAPPAQ13219 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PAPPAQ13219 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PAPPAQ13219 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PAPPAQ13219 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PAPPAQ13219 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
PAPPAQ13219 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PAPPAQ13219 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PAPPAQ13219 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PAPPAQ13219 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PAPPAQ13219 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PAPPAQ13219 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PAPPAQ13219 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PAPPAQ13219 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
PAPPAQ13219 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PAPPAQ13219 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PAPPAQ13219 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PAPPAQ13219 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PAPPAQ13219 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PAPPAQ13219 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PAPPAQ13219 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PAPPAQ13219 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PAPPAQ13219 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PAPPAQ13219 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PAPPAQ13219 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PAPPAQ13219 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PAPPAQ13219 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
PAPPAQ13219 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PAPPAQ13219 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PAPPAQ13219 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PAPPAQ13219 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PAPPAQ13219 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PAPPAQ13219 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
PAPPAQ13219 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PAPPAQ13219 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PAPPAQ13219 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PAPPAQ13219 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37■■■■□ 3.51
PAPPAQ13219 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PAPPAQ13219 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PAPPAQ13219 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PAPPAQ13219 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
PAPPAQ13219 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PAPPAQ13219 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PAPPAQ13219 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PAPPAQ13219 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
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