Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL28Q13084 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL28Q13084 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRPL28Q13084 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL28Q13084 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL28Q13084 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL28Q13084 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL28Q13084 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL28Q13084 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL28Q13084 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MRPL28Q13084 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL28Q13084 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL28Q13084 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL28Q13084 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL28Q13084 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL28Q13084 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL28Q13084 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL28Q13084 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL28Q13084 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL28Q13084 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL28Q13084 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL28Q13084 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL28Q13084 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL28Q13084 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL28Q13084 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL28Q13084 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL28Q13084 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL28Q13084 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL28Q13084 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL28Q13084 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL28Q13084 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL28Q13084 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL28Q13084 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL28Q13084 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL28Q13084 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL28Q13084 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL28Q13084 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL28Q13084 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL28Q13084 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL28Q13084 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL28Q13084 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL28Q13084 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL28Q13084 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL28Q13084 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL28Q13084 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL28Q13084 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL28Q13084 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL28Q13084 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL28Q13084 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL28Q13084 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL28Q13084 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL28Q13084 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL28Q13084 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL28Q13084 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL28Q13084 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL28Q13084 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL28Q13084 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL28Q13084 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL28Q13084 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL28Q13084 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL28Q13084 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL28Q13084 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL28Q13084 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL28Q13084 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL28Q13084 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL28Q13084 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL28Q13084 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL28Q13084 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL28Q13084 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL28Q13084 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL28Q13084 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL28Q13084 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL28Q13084 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL28Q13084 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL28Q13084 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL28Q13084 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL28Q13084 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL28Q13084 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL28Q13084 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL28Q13084 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPL28Q13084 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL28Q13084 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL28Q13084 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL28Q13084 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL28Q13084 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL28Q13084 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL28Q13084 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL28Q13084 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL28Q13084 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL28Q13084 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL28Q13084 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL28Q13084 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL28Q13084 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL28Q13084 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL28Q13084 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL28Q13084 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL28Q13084 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL28Q13084 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MRPL28Q13084 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL28Q13084 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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