Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP4F3Q08477 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP4F3Q08477 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP4F3Q08477 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP4F3Q08477 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP4F3Q08477 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP4F3Q08477 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP4F3Q08477 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP4F3Q08477 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP4F3Q08477 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP4F3Q08477 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CYP4F3Q08477 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP4F3Q08477 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP4F3Q08477 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP4F3Q08477 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP4F3Q08477 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP4F3Q08477 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CYP4F3Q08477 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP4F3Q08477 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP4F3Q08477 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP4F3Q08477 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP4F3Q08477 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP4F3Q08477 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP4F3Q08477 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP4F3Q08477 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP4F3Q08477 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CYP4F3Q08477 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP4F3Q08477 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP4F3Q08477 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP4F3Q08477 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP4F3Q08477 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP4F3Q08477 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP4F3Q08477 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP4F3Q08477 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP4F3Q08477 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP4F3Q08477 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP4F3Q08477 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP4F3Q08477 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP4F3Q08477 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP4F3Q08477 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP4F3Q08477 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP4F3Q08477 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP4F3Q08477 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP4F3Q08477 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP4F3Q08477 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP4F3Q08477 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP4F3Q08477 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP4F3Q08477 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP4F3Q08477 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP4F3Q08477 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP4F3Q08477 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP4F3Q08477 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP4F3Q08477 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP4F3Q08477 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP4F3Q08477 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP4F3Q08477 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP4F3Q08477 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP4F3Q08477 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP4F3Q08477 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP4F3Q08477 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYP4F3Q08477 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYP4F3Q08477 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP4F3Q08477 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP4F3Q08477 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP4F3Q08477 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP4F3Q08477 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP4F3Q08477 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP4F3Q08477 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP4F3Q08477 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP4F3Q08477 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP4F3Q08477 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP4F3Q08477 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP4F3Q08477 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP4F3Q08477 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP4F3Q08477 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP4F3Q08477 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP4F3Q08477 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP4F3Q08477 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP4F3Q08477 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP4F3Q08477 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP4F3Q08477 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP4F3Q08477 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP4F3Q08477 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP4F3Q08477 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP4F3Q08477 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP4F3Q08477 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP4F3Q08477 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP4F3Q08477 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP4F3Q08477 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP4F3Q08477 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP4F3Q08477 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP4F3Q08477 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP4F3Q08477 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP4F3Q08477 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CYP4F3Q08477 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CYP4F3Q08477 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYP4F3Q08477 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYP4F3Q08477 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYP4F3Q08477 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYP4F3Q08477 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms