Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
GOLGA3Q08378 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
GOLGA3Q08378 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
GOLGA3Q08378 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
GOLGA3Q08378 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
GOLGA3Q08378 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC47.64■■■■■ 5.22
GOLGA3Q08378 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC47.59■■■■■ 5.21
GOLGA3Q08378 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
GOLGA3Q08378 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC47.56■■■■■ 5.2
GOLGA3Q08378 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
GOLGA3Q08378 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
GOLGA3Q08378 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.48■■■■■ 5.19
GOLGA3Q08378 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
GOLGA3Q08378 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC47.44■■■■■ 5.18
GOLGA3Q08378 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC47.44■■■■■ 5.18
GOLGA3Q08378 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
GOLGA3Q08378 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
GOLGA3Q08378 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
GOLGA3Q08378 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC47.34■■■■■ 5.17
GOLGA3Q08378 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC47.27■■■■■ 5.16
GOLGA3Q08378 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.15
GOLGA3Q08378 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
GOLGA3Q08378 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
GOLGA3Q08378 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC47.18■■■■■ 5.14
GOLGA3Q08378 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC47.18■■■■■ 5.14
GOLGA3Q08378 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
GOLGA3Q08378 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
GOLGA3Q08378 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
GOLGA3Q08378 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
GOLGA3Q08378 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
GOLGA3Q08378 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
GOLGA3Q08378 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC47.09■■■■■ 5.13
GOLGA3Q08378 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.08■■■■■ 5.13
GOLGA3Q08378 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC47.07■■■■■ 5.13
GOLGA3Q08378 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.06■■■■■ 5.12
GOLGA3Q08378 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC47.04■■■■■ 5.12
GOLGA3Q08378 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC47.02■■■■■ 5.12
GOLGA3Q08378 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
GOLGA3Q08378 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC47.01■■■■■ 5.12
GOLGA3Q08378 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC46.98■■■■■ 5.11
GOLGA3Q08378 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
GOLGA3Q08378 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
GOLGA3Q08378 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
GOLGA3Q08378 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
GOLGA3Q08378 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
GOLGA3Q08378 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC46.92■■■■■ 5.1
GOLGA3Q08378 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
GOLGA3Q08378 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC46.82■■■■■ 5.09
GOLGA3Q08378 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
GOLGA3Q08378 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
GOLGA3Q08378 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC46.76■■■■■ 5.08
GOLGA3Q08378 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
GOLGA3Q08378 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC46.73■■■■■ 5.07
GOLGA3Q08378 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
GOLGA3Q08378 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
GOLGA3Q08378 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC46.69■■■■■ 5.06
GOLGA3Q08378 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
GOLGA3Q08378 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC46.63■■■■■ 5.05
GOLGA3Q08378 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC46.62■■■■■ 5.05
GOLGA3Q08378 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC46.61■■■■■ 5.05
GOLGA3Q08378 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC46.6■■■■■ 5.05
GOLGA3Q08378 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
GOLGA3Q08378 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC46.53■■■■■ 5.04
GOLGA3Q08378 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC46.51■■■■■ 5.04
GOLGA3Q08378 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC46.51■■■■■ 5.04
GOLGA3Q08378 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
GOLGA3Q08378 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
GOLGA3Q08378 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.41■■■■■ 5.02
GOLGA3Q08378 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC46.41■■■■■ 5.02
GOLGA3Q08378 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC46.41■■■■■ 5.02
GOLGA3Q08378 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
GOLGA3Q08378 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.02
GOLGA3Q08378 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
GOLGA3Q08378 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
GOLGA3Q08378 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC46.33■■■■■ 5.01
GOLGA3Q08378 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
GOLGA3Q08378 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC46.31■■■■■ 5
GOLGA3Q08378 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC46.3■■■■■ 5
GOLGA3Q08378 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC46.29■■■■■ 5
GOLGA3Q08378 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
GOLGA3Q08378 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
GOLGA3Q08378 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
GOLGA3Q08378 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
GOLGA3Q08378 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
GOLGA3Q08378 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
GOLGA3Q08378 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 5
GOLGA3Q08378 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
GOLGA3Q08378 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC46.24■■■■■ 4.99
GOLGA3Q08378 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
GOLGA3Q08378 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
GOLGA3Q08378 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC46.2■■■■■ 4.99
GOLGA3Q08378 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
GOLGA3Q08378 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
GOLGA3Q08378 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
GOLGA3Q08378 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
GOLGA3Q08378 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC46.1■■■■■ 4.97
GOLGA3Q08378 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC46.07■■■■■ 4.97
GOLGA3Q08378 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC46.05■■■■■ 4.96
GOLGA3Q08378 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC46.03■■■■■ 4.96
GOLGA3Q08378 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms