Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFF3Q07654 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TFF3Q07654 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFF3Q07654 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFF3Q07654 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFF3Q07654 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFF3Q07654 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFF3Q07654 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFF3Q07654 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFF3Q07654 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFF3Q07654 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFF3Q07654 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFF3Q07654 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFF3Q07654 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFF3Q07654 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFF3Q07654 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFF3Q07654 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFF3Q07654 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFF3Q07654 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFF3Q07654 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFF3Q07654 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFF3Q07654 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TFF3Q07654 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFF3Q07654 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFF3Q07654 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFF3Q07654 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFF3Q07654 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFF3Q07654 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TFF3Q07654 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFF3Q07654 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFF3Q07654 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFF3Q07654 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFF3Q07654 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFF3Q07654 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFF3Q07654 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFF3Q07654 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFF3Q07654 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFF3Q07654 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFF3Q07654 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TFF3Q07654 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFF3Q07654 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TFF3Q07654 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFF3Q07654 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFF3Q07654 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TFF3Q07654 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFF3Q07654 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFF3Q07654 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFF3Q07654 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFF3Q07654 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFF3Q07654 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFF3Q07654 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TFF3Q07654 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFF3Q07654 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFF3Q07654 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFF3Q07654 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFF3Q07654 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFF3Q07654 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFF3Q07654 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFF3Q07654 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFF3Q07654 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFF3Q07654 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFF3Q07654 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFF3Q07654 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFF3Q07654 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFF3Q07654 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFF3Q07654 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFF3Q07654 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFF3Q07654 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFF3Q07654 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFF3Q07654 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFF3Q07654 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFF3Q07654 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFF3Q07654 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TFF3Q07654 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFF3Q07654 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFF3Q07654 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFF3Q07654 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFF3Q07654 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFF3Q07654 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFF3Q07654 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFF3Q07654 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TFF3Q07654 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFF3Q07654 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFF3Q07654 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TFF3Q07654 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFF3Q07654 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TFF3Q07654 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFF3Q07654 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFF3Q07654 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFF3Q07654 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFF3Q07654 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFF3Q07654 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFF3Q07654 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFF3Q07654 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFF3Q07654 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFF3Q07654 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFF3Q07654 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TFF3Q07654 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TFF3Q07654 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFF3Q07654 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms