Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TLE4Q04727 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TLE4Q04727 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TLE4Q04727 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TLE4Q04727 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TLE4Q04727 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TLE4Q04727 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TLE4Q04727 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TLE4Q04727 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TLE4Q04727 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TLE4Q04727 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TLE4Q04727 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLE4Q04727 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TLE4Q04727 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLE4Q04727 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLE4Q04727 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TLE4Q04727 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLE4Q04727 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLE4Q04727 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLE4Q04727 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLE4Q04727 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLE4Q04727 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLE4Q04727 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLE4Q04727 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLE4Q04727 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLE4Q04727 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TLE4Q04727 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLE4Q04727 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TLE4Q04727 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLE4Q04727 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLE4Q04727 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLE4Q04727 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLE4Q04727 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLE4Q04727 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLE4Q04727 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLE4Q04727 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TLE4Q04727 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TLE4Q04727 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLE4Q04727 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLE4Q04727 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLE4Q04727 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLE4Q04727 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLE4Q04727 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TLE4Q04727 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLE4Q04727 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLE4Q04727 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLE4Q04727 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TLE4Q04727 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLE4Q04727 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLE4Q04727 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLE4Q04727 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLE4Q04727 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLE4Q04727 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLE4Q04727 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLE4Q04727 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLE4Q04727 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLE4Q04727 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLE4Q04727 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLE4Q04727 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TLE4Q04727 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLE4Q04727 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TLE4Q04727 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLE4Q04727 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLE4Q04727 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLE4Q04727 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLE4Q04727 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLE4Q04727 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLE4Q04727 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLE4Q04727 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLE4Q04727 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLE4Q04727 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLE4Q04727 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLE4Q04727 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLE4Q04727 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLE4Q04727 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLE4Q04727 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLE4Q04727 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLE4Q04727 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLE4Q04727 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLE4Q04727 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TLE4Q04727 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLE4Q04727 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLE4Q04727 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLE4Q04727 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLE4Q04727 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLE4Q04727 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TLE4Q04727 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLE4Q04727 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TLE4Q04727 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLE4Q04727 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLE4Q04727 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLE4Q04727 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLE4Q04727 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLE4Q04727 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLE4Q04727 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLE4Q04727 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TLE4Q04727 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLE4Q04727 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLE4Q04727 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLE4Q04727 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms