Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC52.74■■■■■ 6.03
ERCC6Q03468 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.68■■■■■ 6.02
ERCC6Q03468 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC52.66■■■■■ 6.02
ERCC6Q03468 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.65■■■■■ 6.02
ERCC6Q03468 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC52.54■■■■■ 6
ERCC6Q03468 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC52.52■■■■■ 6
ERCC6Q03468 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.49■■■■■ 5.99
ERCC6Q03468 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC52.49■■■■■ 5.99
ERCC6Q03468 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC52.46■■■■■ 5.99
ERCC6Q03468 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
ERCC6Q03468 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC52.24■■■■■ 5.95
ERCC6Q03468 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.23■■■■■ 5.95
ERCC6Q03468 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC52.21■■■■■ 5.95
ERCC6Q03468 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.17■■■■■ 5.94
ERCC6Q03468 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.12■■■■■ 5.93
ERCC6Q03468 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.12■■■■■ 5.93
ERCC6Q03468 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC52.11■■■■■ 5.93
ERCC6Q03468 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC52.11■■■■■ 5.93
ERCC6Q03468 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.06■■■■■ 5.92
ERCC6Q03468 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC52.03■■■■■ 5.92
ERCC6Q03468 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
ERCC6Q03468 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC51.99■■■■■ 5.91
ERCC6Q03468 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC51.93■■■■■ 5.9
ERCC6Q03468 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.92■■■■■ 5.9
ERCC6Q03468 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
ERCC6Q03468 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC51.85■■■■■ 5.89
ERCC6Q03468 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC51.8■■■■■ 5.88
ERCC6Q03468 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC51.8■■■■■ 5.88
ERCC6Q03468 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.78■■■■■ 5.88
ERCC6Q03468 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
ERCC6Q03468 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC51.69■■■■■ 5.87
ERCC6Q03468 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.62■■■■■ 5.85
ERCC6Q03468 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC51.62■■■■■ 5.85
ERCC6Q03468 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
ERCC6Q03468 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.61■■■■■ 5.85
ERCC6Q03468 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC51.55■■■■■ 5.84
ERCC6Q03468 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC51.55■■■■■ 5.84
ERCC6Q03468 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC51.55■■■■■ 5.84
ERCC6Q03468 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC51.54■■■■■ 5.84
ERCC6Q03468 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC51.54■■■■■ 5.84
ERCC6Q03468 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.54■■■■■ 5.84
ERCC6Q03468 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.51■■■■■ 5.84
ERCC6Q03468 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
ERCC6Q03468 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
ERCC6Q03468 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
ERCC6Q03468 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.44■■■■■ 5.83
ERCC6Q03468 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC51.42■■■■■ 5.82
ERCC6Q03468 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC51.41■■■■■ 5.82
ERCC6Q03468 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC51.41■■■■■ 5.82
ERCC6Q03468 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC51.39■■■■■ 5.82
ERCC6Q03468 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
ERCC6Q03468 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC51.3■■■■■ 5.8
ERCC6Q03468 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC51.26■■■■■ 5.8
ERCC6Q03468 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
ERCC6Q03468 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC51.19■■■■■ 5.79
ERCC6Q03468 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.18■■■■■ 5.78
ERCC6Q03468 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.17■■■■■ 5.78
ERCC6Q03468 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC51.1■■■■■ 5.77
ERCC6Q03468 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.09■■■■■ 5.77
ERCC6Q03468 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC51.09■■■■■ 5.77
ERCC6Q03468 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC51.08■■■■■ 5.77
ERCC6Q03468 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC51.07■■■■■ 5.77
ERCC6Q03468 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
ERCC6Q03468 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC51.03■■■■■ 5.76
ERCC6Q03468 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC51■■■■■ 5.75
ERCC6Q03468 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC50.99■■■■■ 5.75
ERCC6Q03468 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
ERCC6Q03468 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
ERCC6Q03468 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC50.87■■■■■ 5.73
ERCC6Q03468 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC50.87■■■■■ 5.73
ERCC6Q03468 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
ERCC6Q03468 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC50.83■■■■■ 5.73
ERCC6Q03468 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
ERCC6Q03468 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
ERCC6Q03468 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC50.82■■■■■ 5.73
ERCC6Q03468 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.8■■■■■ 5.72
ERCC6Q03468 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
ERCC6Q03468 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC50.78■■■■■ 5.72
ERCC6Q03468 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC50.77■■■■■ 5.72
ERCC6Q03468 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC50.77■■■■■ 5.72
ERCC6Q03468 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
ERCC6Q03468 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC50.75■■■■■ 5.71
ERCC6Q03468 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
ERCC6Q03468 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
ERCC6Q03468 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.7■■■■■ 5.71
ERCC6Q03468 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
ERCC6Q03468 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.65■■■■■ 5.7
ERCC6Q03468 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC50.65■■■■■ 5.7
ERCC6Q03468 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
ERCC6Q03468 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
ERCC6Q03468 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC50.55■■■■■ 5.68
ERCC6Q03468 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC50.54■■■■■ 5.68
ERCC6Q03468 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.51■■■■■ 5.68
ERCC6Q03468 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC50.46■■■■■ 5.67
ERCC6Q03468 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
ERCC6Q03468 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC50.42■■■■■ 5.66
ERCC6Q03468 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC50.41■■■■■ 5.66
ERCC6Q03468 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC50.41■■■■■ 5.66
ERCC6Q03468 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC50.35■■■■■ 5.65
ERCC6Q03468 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC50.34■■■■■ 5.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms