Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CNTNAP1P78357 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CNTNAP1P78357 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CNTNAP1P78357 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CNTNAP1P78357 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CNTNAP1P78357 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CNTNAP1P78357 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CNTNAP1P78357 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CNTNAP1P78357 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
CNTNAP1P78357 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CNTNAP1P78357 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
CNTNAP1P78357 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CNTNAP1P78357 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CNTNAP1P78357 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CNTNAP1P78357 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CNTNAP1P78357 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CNTNAP1P78357 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CNTNAP1P78357 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CNTNAP1P78357 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
CNTNAP1P78357 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.38■■■■□ 3.26
CNTNAP1P78357 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CNTNAP1P78357 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CNTNAP1P78357 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CNTNAP1P78357 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CNTNAP1P78357 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CNTNAP1P78357 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CNTNAP1P78357 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CNTNAP1P78357 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CNTNAP1P78357 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CNTNAP1P78357 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CNTNAP1P78357 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CNTNAP1P78357 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CNTNAP1P78357 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CNTNAP1P78357 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CNTNAP1P78357 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CNTNAP1P78357 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CNTNAP1P78357 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CNTNAP1P78357 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNTNAP1P78357 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CNTNAP1P78357 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CNTNAP1P78357 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CNTNAP1P78357 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CNTNAP1P78357 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CNTNAP1P78357 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CNTNAP1P78357 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CNTNAP1P78357 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CNTNAP1P78357 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CNTNAP1P78357 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CNTNAP1P78357 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CNTNAP1P78357 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CNTNAP1P78357 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CNTNAP1P78357 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CNTNAP1P78357 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CNTNAP1P78357 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CNTNAP1P78357 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CNTNAP1P78357 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CNTNAP1P78357 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CNTNAP1P78357 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CNTNAP1P78357 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CNTNAP1P78357 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CNTNAP1P78357 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CNTNAP1P78357 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CNTNAP1P78357 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CNTNAP1P78357 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CNTNAP1P78357 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CNTNAP1P78357 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CNTNAP1P78357 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CNTNAP1P78357 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CNTNAP1P78357 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CNTNAP1P78357 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CNTNAP1P78357 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CNTNAP1P78357 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CNTNAP1P78357 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CNTNAP1P78357 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CNTNAP1P78357 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CNTNAP1P78357 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CNTNAP1P78357 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CNTNAP1P78357 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CNTNAP1P78357 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CNTNAP1P78357 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CNTNAP1P78357 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CNTNAP1P78357 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CNTNAP1P78357 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CNTNAP1P78357 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CNTNAP1P78357 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CNTNAP1P78357 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CNTNAP1P78357 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CNTNAP1P78357 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CNTNAP1P78357 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CNTNAP1P78357 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CNTNAP1P78357 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CNTNAP1P78357 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CNTNAP1P78357 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CNTNAP1P78357 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTNAP1P78357 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CNTNAP1P78357 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CNTNAP1P78357 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CNTNAP1P78357 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CNTNAP1P78357 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNTNAP1P78357 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms