Protein–RNA interactions for Protein: P61619

SEC61A1, Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC61A1P61619 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC61A1P61619 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC61A1P61619 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC61A1P61619 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC61A1P61619 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC61A1P61619 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC61A1P61619 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC61A1P61619 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC61A1P61619 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC61A1P61619 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC61A1P61619 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC61A1P61619 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC61A1P61619 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC61A1P61619 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC61A1P61619 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC61A1P61619 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC61A1P61619 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC61A1P61619 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC61A1P61619 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC61A1P61619 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC61A1P61619 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC61A1P61619 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC61A1P61619 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC61A1P61619 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC61A1P61619 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC61A1P61619 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC61A1P61619 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC61A1P61619 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC61A1P61619 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC61A1P61619 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC61A1P61619 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC61A1P61619 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC61A1P61619 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC61A1P61619 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC61A1P61619 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC61A1P61619 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC61A1P61619 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC61A1P61619 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC61A1P61619 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC61A1P61619 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC61A1P61619 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC61A1P61619 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC61A1P61619 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC61A1P61619 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC61A1P61619 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC61A1P61619 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC61A1P61619 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC61A1P61619 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC61A1P61619 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC61A1P61619 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC61A1P61619 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC61A1P61619 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC61A1P61619 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC61A1P61619 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC61A1P61619 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC61A1P61619 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC61A1P61619 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC61A1P61619 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC61A1P61619 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC61A1P61619 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC61A1P61619 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC61A1P61619 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC61A1P61619 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC61A1P61619 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC61A1P61619 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC61A1P61619 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC61A1P61619 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC61A1P61619 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC61A1P61619 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC61A1P61619 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC61A1P61619 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC61A1P61619 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC61A1P61619 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC61A1P61619 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC61A1P61619 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC61A1P61619 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC61A1P61619 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC61A1P61619 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC61A1P61619 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC61A1P61619 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC61A1P61619 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC61A1P61619 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC61A1P61619 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC61A1P61619 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC61A1P61619 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC61A1P61619 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC61A1P61619 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC61A1P61619 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC61A1P61619 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC61A1P61619 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC61A1P61619 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC61A1P61619 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC61A1P61619 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC61A1P61619 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC61A1P61619 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC61A1P61619 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC61A1P61619 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC61A1P61619 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC61A1P61619 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC61A1P61619 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms