Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABARAPL2P60520 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABARAPL2P60520 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABARAPL2P60520 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABARAPL2P60520 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABARAPL2P60520 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GABARAPL2P60520 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABARAPL2P60520 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABARAPL2P60520 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABARAPL2P60520 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABARAPL2P60520 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABARAPL2P60520 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABARAPL2P60520 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GABARAPL2P60520 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABARAPL2P60520 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABARAPL2P60520 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GABARAPL2P60520 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABARAPL2P60520 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABARAPL2P60520 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABARAPL2P60520 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABARAPL2P60520 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GABARAPL2P60520 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABARAPL2P60520 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABARAPL2P60520 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GABARAPL2P60520 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GABARAPL2P60520 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABARAPL2P60520 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABARAPL2P60520 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABARAPL2P60520 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABARAPL2P60520 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABARAPL2P60520 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABARAPL2P60520 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GABARAPL2P60520 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABARAPL2P60520 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABARAPL2P60520 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABARAPL2P60520 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABARAPL2P60520 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GABARAPL2P60520 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABARAPL2P60520 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABARAPL2P60520 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABARAPL2P60520 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABARAPL2P60520 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABARAPL2P60520 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABARAPL2P60520 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABARAPL2P60520 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABARAPL2P60520 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABARAPL2P60520 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABARAPL2P60520 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABARAPL2P60520 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABARAPL2P60520 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABARAPL2P60520 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GABARAPL2P60520 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABARAPL2P60520 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABARAPL2P60520 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABARAPL2P60520 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABARAPL2P60520 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABARAPL2P60520 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABARAPL2P60520 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABARAPL2P60520 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABARAPL2P60520 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABARAPL2P60520 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABARAPL2P60520 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABARAPL2P60520 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABARAPL2P60520 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABARAPL2P60520 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABARAPL2P60520 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABARAPL2P60520 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABARAPL2P60520 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABARAPL2P60520 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABARAPL2P60520 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABARAPL2P60520 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABARAPL2P60520 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABARAPL2P60520 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABARAPL2P60520 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABARAPL2P60520 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABARAPL2P60520 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABARAPL2P60520 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABARAPL2P60520 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABARAPL2P60520 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABARAPL2P60520 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABARAPL2P60520 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABARAPL2P60520 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABARAPL2P60520 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABARAPL2P60520 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABARAPL2P60520 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABARAPL2P60520 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABARAPL2P60520 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABARAPL2P60520 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABARAPL2P60520 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GABARAPL2P60520 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABARAPL2P60520 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABARAPL2P60520 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABARAPL2P60520 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABARAPL2P60520 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABARAPL2P60520 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GABARAPL2P60520 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABARAPL2P60520 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABARAPL2P60520 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABARAPL2P60520 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABARAPL2P60520 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms