Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
RHBDL3P58872 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
RHBDL3P58872 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RHBDL3P58872 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
RHBDL3P58872 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RHBDL3P58872 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RHBDL3P58872 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RHBDL3P58872 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RHBDL3P58872 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RHBDL3P58872 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RHBDL3P58872 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RHBDL3P58872 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RHBDL3P58872 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RHBDL3P58872 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RHBDL3P58872 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RHBDL3P58872 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RHBDL3P58872 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RHBDL3P58872 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RHBDL3P58872 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RHBDL3P58872 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RHBDL3P58872 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RHBDL3P58872 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RHBDL3P58872 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RHBDL3P58872 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RHBDL3P58872 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RHBDL3P58872 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RHBDL3P58872 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RHBDL3P58872 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RHBDL3P58872 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RHBDL3P58872 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RHBDL3P58872 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RHBDL3P58872 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RHBDL3P58872 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RHBDL3P58872 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RHBDL3P58872 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
RHBDL3P58872 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RHBDL3P58872 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RHBDL3P58872 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RHBDL3P58872 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RHBDL3P58872 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RHBDL3P58872 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RHBDL3P58872 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RHBDL3P58872 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RHBDL3P58872 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RHBDL3P58872 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RHBDL3P58872 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RHBDL3P58872 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RHBDL3P58872 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RHBDL3P58872 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RHBDL3P58872 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RHBDL3P58872 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RHBDL3P58872 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RHBDL3P58872 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RHBDL3P58872 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RHBDL3P58872 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RHBDL3P58872 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RHBDL3P58872 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RHBDL3P58872 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RHBDL3P58872 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RHBDL3P58872 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RHBDL3P58872 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RHBDL3P58872 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RHBDL3P58872 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RHBDL3P58872 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RHBDL3P58872 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RHBDL3P58872 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RHBDL3P58872 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
RHBDL3P58872 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RHBDL3P58872 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RHBDL3P58872 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RHBDL3P58872 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RHBDL3P58872 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RHBDL3P58872 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RHBDL3P58872 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RHBDL3P58872 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RHBDL3P58872 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RHBDL3P58872 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RHBDL3P58872 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RHBDL3P58872 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RHBDL3P58872 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RHBDL3P58872 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
RHBDL3P58872 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RHBDL3P58872 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RHBDL3P58872 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RHBDL3P58872 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RHBDL3P58872 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RHBDL3P58872 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RHBDL3P58872 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RHBDL3P58872 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RHBDL3P58872 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RHBDL3P58872 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RHBDL3P58872 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
RHBDL3P58872 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RHBDL3P58872 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RHBDL3P58872 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RHBDL3P58872 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RHBDL3P58872 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RHBDL3P58872 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RHBDL3P58872 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RHBDL3P58872 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms