Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
VCPP55072 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
VCPP55072 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
VCPP55072 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
VCPP55072 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
VCPP55072 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
VCPP55072 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VCPP55072 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
VCPP55072 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
VCPP55072 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
VCPP55072 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
VCPP55072 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
VCPP55072 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
VCPP55072 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
VCPP55072 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
VCPP55072 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
VCPP55072 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
VCPP55072 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
VCPP55072 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
VCPP55072 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
VCPP55072 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
VCPP55072 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
VCPP55072 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
VCPP55072 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VCPP55072 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
VCPP55072 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
VCPP55072 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
VCPP55072 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
VCPP55072 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
VCPP55072 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
VCPP55072 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
VCPP55072 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
VCPP55072 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
VCPP55072 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
VCPP55072 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VCPP55072 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VCPP55072 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
VCPP55072 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
VCPP55072 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VCPP55072 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VCPP55072 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
VCPP55072 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
VCPP55072 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
VCPP55072 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
VCPP55072 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
VCPP55072 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VCPP55072 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VCPP55072 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VCPP55072 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VCPP55072 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
VCPP55072 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VCPP55072 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
VCPP55072 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VCPP55072 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VCPP55072 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
VCPP55072 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VCPP55072 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
VCPP55072 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VCPP55072 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VCPP55072 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
VCPP55072 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VCPP55072 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VCPP55072 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VCPP55072 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VCPP55072 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VCPP55072 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
VCPP55072 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
VCPP55072 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VCPP55072 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VCPP55072 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VCPP55072 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VCPP55072 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VCPP55072 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
VCPP55072 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
VCPP55072 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VCPP55072 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VCPP55072 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VCPP55072 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VCPP55072 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VCPP55072 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VCPP55072 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VCPP55072 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VCPP55072 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VCPP55072 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VCPP55072 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VCPP55072 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VCPP55072 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VCPP55072 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VCPP55072 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VCPP55072 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VCPP55072 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VCPP55072 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VCPP55072 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VCPP55072 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VCPP55072 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VCPP55072 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VCPP55072 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VCPP55072 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VCPP55072 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VCPP55072 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms