Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPN5P54829 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPN5P54829 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPN5P54829 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPN5P54829 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPN5P54829 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPN5P54829 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPN5P54829 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPN5P54829 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPN5P54829 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPN5P54829 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPN5P54829 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPN5P54829 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPN5P54829 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPN5P54829 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPN5P54829 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPN5P54829 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPN5P54829 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPN5P54829 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPN5P54829 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPN5P54829 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPN5P54829 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPN5P54829 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPN5P54829 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPN5P54829 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPN5P54829 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PTPN5P54829 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN5P54829 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN5P54829 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN5P54829 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPN5P54829 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPN5P54829 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPN5P54829 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPN5P54829 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPN5P54829 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN5P54829 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN5P54829 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPN5P54829 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPN5P54829 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPN5P54829 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPN5P54829 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPN5P54829 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPN5P54829 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPN5P54829 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPN5P54829 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPN5P54829 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN5P54829 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPN5P54829 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPN5P54829 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPN5P54829 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPN5P54829 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPN5P54829 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPN5P54829 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN5P54829 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPN5P54829 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPN5P54829 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN5P54829 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN5P54829 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN5P54829 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN5P54829 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPN5P54829 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPN5P54829 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN5P54829 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN5P54829 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN5P54829 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN5P54829 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN5P54829 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN5P54829 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPN5P54829 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN5P54829 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPN5P54829 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPN5P54829 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN5P54829 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN5P54829 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPN5P54829 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN5P54829 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN5P54829 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN5P54829 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN5P54829 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPN5P54829 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN5P54829 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN5P54829 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPN5P54829 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN5P54829 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN5P54829 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN5P54829 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN5P54829 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN5P54829 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN5P54829 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN5P54829 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN5P54829 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN5P54829 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPN5P54829 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN5P54829 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN5P54829 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN5P54829 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN5P54829 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN5P54829 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN5P54829 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPN5P54829 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms