Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMSP52788 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMSP52788 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMSP52788 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMSP52788 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMSP52788 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMSP52788 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMSP52788 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMSP52788 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMSP52788 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMSP52788 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMSP52788 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMSP52788 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMSP52788 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMSP52788 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMSP52788 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMSP52788 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMSP52788 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMSP52788 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMSP52788 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMSP52788 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMSP52788 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMSP52788 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMSP52788 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMSP52788 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMSP52788 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMSP52788 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMSP52788 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMSP52788 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMSP52788 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMSP52788 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMSP52788 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMSP52788 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMSP52788 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMSP52788 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SMSP52788 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMSP52788 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMSP52788 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMSP52788 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMSP52788 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SMSP52788 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMSP52788 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMSP52788 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMSP52788 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMSP52788 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMSP52788 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMSP52788 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMSP52788 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMSP52788 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMSP52788 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMSP52788 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMSP52788 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMSP52788 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMSP52788 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMSP52788 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMSP52788 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMSP52788 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMSP52788 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMSP52788 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMSP52788 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMSP52788 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMSP52788 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMSP52788 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMSP52788 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMSP52788 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMSP52788 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMSP52788 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMSP52788 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMSP52788 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMSP52788 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMSP52788 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMSP52788 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMSP52788 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMSP52788 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMSP52788 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMSP52788 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMSP52788 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMSP52788 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMSP52788 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMSP52788 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMSP52788 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMSP52788 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMSP52788 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMSP52788 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMSP52788 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMSP52788 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMSP52788 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMSP52788 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMSP52788 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMSP52788 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMSP52788 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMSP52788 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMSP52788 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMSP52788 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMSP52788 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMSP52788 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMSP52788 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMSP52788 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMSP52788 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMSP52788 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms