Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSK3BP49841 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSK3BP49841 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSK3BP49841 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSK3BP49841 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSK3BP49841 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSK3BP49841 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GSK3BP49841 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GSK3BP49841 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSK3BP49841 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSK3BP49841 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GSK3BP49841 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GSK3BP49841 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GSK3BP49841 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GSK3BP49841 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GSK3BP49841 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GSK3BP49841 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GSK3BP49841 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GSK3BP49841 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GSK3BP49841 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSK3BP49841 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSK3BP49841 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GSK3BP49841 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GSK3BP49841 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GSK3BP49841 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GSK3BP49841 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSK3BP49841 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSK3BP49841 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSK3BP49841 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSK3BP49841 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSK3BP49841 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSK3BP49841 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSK3BP49841 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSK3BP49841 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSK3BP49841 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GSK3BP49841 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GSK3BP49841 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GSK3BP49841 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GSK3BP49841 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GSK3BP49841 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GSK3BP49841 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSK3BP49841 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSK3BP49841 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSK3BP49841 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSK3BP49841 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSK3BP49841 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GSK3BP49841 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GSK3BP49841 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GSK3BP49841 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GSK3BP49841 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GSK3BP49841 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GSK3BP49841 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GSK3BP49841 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GSK3BP49841 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GSK3BP49841 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GSK3BP49841 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSK3BP49841 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSK3BP49841 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSK3BP49841 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSK3BP49841 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSK3BP49841 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSK3BP49841 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSK3BP49841 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GSK3BP49841 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSK3BP49841 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSK3BP49841 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSK3BP49841 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSK3BP49841 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSK3BP49841 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSK3BP49841 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSK3BP49841 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSK3BP49841 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSK3BP49841 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSK3BP49841 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSK3BP49841 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSK3BP49841 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSK3BP49841 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSK3BP49841 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSK3BP49841 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GSK3BP49841 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GSK3BP49841 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GSK3BP49841 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSK3BP49841 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GSK3BP49841 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GSK3BP49841 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GSK3BP49841 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GSK3BP49841 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GSK3BP49841 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GSK3BP49841 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GSK3BP49841 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GSK3BP49841 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GSK3BP49841 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GSK3BP49841 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GSK3BP49841 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GSK3BP49841 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GSK3BP49841 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSK3BP49841 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSK3BP49841 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSK3BP49841 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GSK3BP49841 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms