Protein–RNA interactions for Protein: P49585

PCYT1A, Choline-phosphate cytidylyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1AP49585 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCYT1AP49585 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCYT1AP49585 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCYT1AP49585 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCYT1AP49585 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCYT1AP49585 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCYT1AP49585 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCYT1AP49585 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCYT1AP49585 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCYT1AP49585 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCYT1AP49585 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCYT1AP49585 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCYT1AP49585 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCYT1AP49585 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCYT1AP49585 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCYT1AP49585 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCYT1AP49585 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCYT1AP49585 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCYT1AP49585 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCYT1AP49585 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCYT1AP49585 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCYT1AP49585 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCYT1AP49585 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCYT1AP49585 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCYT1AP49585 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCYT1AP49585 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCYT1AP49585 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCYT1AP49585 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCYT1AP49585 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCYT1AP49585 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCYT1AP49585 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCYT1AP49585 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCYT1AP49585 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCYT1AP49585 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCYT1AP49585 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCYT1AP49585 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCYT1AP49585 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCYT1AP49585 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCYT1AP49585 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCYT1AP49585 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCYT1AP49585 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCYT1AP49585 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCYT1AP49585 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PCYT1AP49585 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCYT1AP49585 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCYT1AP49585 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCYT1AP49585 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCYT1AP49585 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCYT1AP49585 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCYT1AP49585 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCYT1AP49585 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCYT1AP49585 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCYT1AP49585 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms