Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCT5P48643 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCT5P48643 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCT5P48643 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCT5P48643 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCT5P48643 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCT5P48643 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCT5P48643 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCT5P48643 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCT5P48643 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCT5P48643 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCT5P48643 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCT5P48643 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCT5P48643 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCT5P48643 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCT5P48643 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCT5P48643 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCT5P48643 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCT5P48643 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCT5P48643 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCT5P48643 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCT5P48643 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCT5P48643 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCT5P48643 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCT5P48643 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCT5P48643 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCT5P48643 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCT5P48643 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCT5P48643 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCT5P48643 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCT5P48643 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCT5P48643 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCT5P48643 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCT5P48643 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCT5P48643 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCT5P48643 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCT5P48643 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCT5P48643 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCT5P48643 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCT5P48643 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCT5P48643 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCT5P48643 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT5P48643 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT5P48643 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT5P48643 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCT5P48643 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCT5P48643 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCT5P48643 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCT5P48643 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCT5P48643 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCT5P48643 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCT5P48643 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCT5P48643 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCT5P48643 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCT5P48643 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCT5P48643 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCT5P48643 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCT5P48643 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCT5P48643 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCT5P48643 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCT5P48643 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCT5P48643 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCT5P48643 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT5P48643 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT5P48643 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT5P48643 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT5P48643 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT5P48643 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCT5P48643 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCT5P48643 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCT5P48643 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCT5P48643 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCT5P48643 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCT5P48643 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCT5P48643 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCT5P48643 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCT5P48643 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCT5P48643 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCT5P48643 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCT5P48643 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCT5P48643 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT5P48643 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT5P48643 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCT5P48643 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCT5P48643 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCT5P48643 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCT5P48643 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCT5P48643 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCT5P48643 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCT5P48643 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCT5P48643 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCT5P48643 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCT5P48643 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCT5P48643 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCT5P48643 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCT5P48643 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCT5P48643 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCT5P48643 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCT5P48643 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCT5P48643 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms