Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SOX9P48436 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SOX9P48436 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SOX9P48436 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SOX9P48436 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SOX9P48436 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SOX9P48436 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SOX9P48436 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SOX9P48436 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SOX9P48436 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SOX9P48436 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SOX9P48436 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SOX9P48436 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SOX9P48436 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SOX9P48436 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SOX9P48436 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SOX9P48436 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SOX9P48436 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SOX9P48436 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SOX9P48436 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SOX9P48436 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SOX9P48436 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SOX9P48436 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOX9P48436 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOX9P48436 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SOX9P48436 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOX9P48436 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOX9P48436 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOX9P48436 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SOX9P48436 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOX9P48436 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOX9P48436 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOX9P48436 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOX9P48436 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOX9P48436 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOX9P48436 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOX9P48436 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SOX9P48436 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SOX9P48436 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOX9P48436 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SOX9P48436 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SOX9P48436 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SOX9P48436 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SOX9P48436 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SOX9P48436 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SOX9P48436 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SOX9P48436 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SOX9P48436 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SOX9P48436 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SOX9P48436 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SOX9P48436 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SOX9P48436 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SOX9P48436 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SOX9P48436 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SOX9P48436 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SOX9P48436 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SOX9P48436 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOX9P48436 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOX9P48436 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOX9P48436 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOX9P48436 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SOX9P48436 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SOX9P48436 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SOX9P48436 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SOX9P48436 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SOX9P48436 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SOX9P48436 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SOX9P48436 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SOX9P48436 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SOX9P48436 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SOX9P48436 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SOX9P48436 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOX9P48436 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOX9P48436 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOX9P48436 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOX9P48436 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOX9P48436 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SOX9P48436 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOX9P48436 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SOX9P48436 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SOX9P48436 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SOX9P48436 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SOX9P48436 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SOX9P48436 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SOX9P48436 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SOX9P48436 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SOX9P48436 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SOX9P48436 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SOX9P48436 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SOX9P48436 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SOX9P48436 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SOX9P48436 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SOX9P48436 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SOX9P48436 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SOX9P48436 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOX9P48436 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SOX9P48436 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SOX9P48436 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SOX9P48436 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOX9P48436 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms